唐軍順利接收漢中與河南中南部，順軍便按先前規劃，佈防於秦嶺北邊，和河南劃定的兩軍交接線處，與唐軍兩邊對峙，倒是極有默契地保持了平靜的局面。
唐順雙方至此，都獲得了極其想要的和平。
在大順國中，李自成採納牛金星等人的意見，開始裁汰軍中老弱，減輕財政負擔，同時大力編練新兵，以備將來之戰。
與此同時，他下令在全國範圍內，大拓殖荒地以增加糧食產量，強制成年男女婚配以增加人口數量。
李自成亦下令，要學唐軍的火器建軍模式，開始組織國中技術人員，開始進行軍械研究。準備也要與唐軍一樣，在火器方面大力研發，全面提升軍隊的火器作戰能力，爭取不至於落後唐軍太多，最好能達到與唐軍形成勉強的火器力量平衡。
而在唐軍這邊，諸如調派新任命的朝廷官員，安置新得地區的百姓，恢復當地的生產生活秩序，加緊整編訓練新編的兩鎮兵馬的工作，皆已是有條不紊的進行。
而除了這些之外，李嘯決定，還是按原計劃，下達了對整個西南地區的改土歸流工作。
改土歸流是指改土司製為流官制，始於明朝中後期，是指將原來西南地區統治少數民族的土司頭目廢除，改為朝廷中央政府派任流官。
簡而言之，改土歸流就是把少數民族土司管理的方式改為政府官員管理方式。土司即原民族的首領，流官由朝廷中央委派。改土歸流有利於消除土司制度的落後性，同時加強中央對西南一些少數民族聚居地區的統治。
改土歸流，自明代中葉以後便逐步開始。它是在土官與封建王朝的矛盾日益尖銳的情況下產生的。這個矛盾，唐、宋以來就長期存在。隨著社會生產力的不斷發展，土官制度越來越不適應社會的需要。
與此同時，土官又日益與朝廷鬧對立，反對朝廷對它的管轄。這種有損於國家統一的行為，明王朝自然是不能容忍的。於是“改土歸流“是勢在必行。
而明朝的做法，其實是比較緩和的。如遇到土官絕嗣、土官之間互相仇殺或叛亂被平定、土官犯罪革職等.當地的土司制度即被廢除，改由流官接任。
饒是如此，由於明王朝的舉措，基本是與土司利益為對立面，故各地多有叛亂。其中，最大規模的便是烏蒙土司的叛亂，當然，最終亦被朝廷順利鎮壓。
借鑑到明王朝的相關經驗，李嘯決定，在西南地區開始的改土歸流工作，要根據土司具體情況，分成三大部份，分別對待並開展。
由於西南地域廣闊，土司眾多，李嘯並沒有急於求成的對所有的土司，來個一刀切的粗暴推進，而是首先將土司分成三個部分。
第一部分，是勢力較小，兵馬薄弱，但卻與唐軍關係較好，甚至在唐軍征戰西南，加入唐軍或輔助唐軍作戰的當地土司。對於這部分土司，李嘯決定，暫不對他們進行改土分流工作，而是繼續保持原狀。希望以這種方式，讓這些土司繼續維持與自已的友好關係。
這部份的土司改土歸流工作，李嘯打算最後進行，甚至在統一全國之後，再進行亦無不可。
第二部分，則是勢力一般，兵馬不多，與唐軍關係也一般，在唐軍攻伐西南時，採取中立態度的當地土司。李嘯給他們限了一年的時間，準允他們逐步改進，讓他們最終同意進行改土歸流，讓朝廷派駐官員，來代替一直實施的土司制度。
而第三部分，則是勢力較大，兵馬也多，但是卻與唐軍關係不佳，曾站於唐軍對立面，後來卻被迫臣服的當地大土司。對於這些土司，李嘯決定首先拿他們開刀，要他們立刻整改，改土歸流，不可違抗，以達到擒賊先擒王的效果。
於是，在李嘯的密令下，西南各地的唐軍各鎮兵馬，趕在朝廷召令前，悄悄來到了那些可能反叛的大土司之處駐紮安頓。