原來這兩部因為支援安福系，挪用了許多公款，如果追查起來，麻煩就大了。可是，不把先前的賬目理清楚，誰願意帶人受過，這當然是無法保證的事。哪個新部長上任，會接一筆亂帳。這一天的交換意見，基本上是無果而終。
此後一連三天，大家在幕後磋商，段祺瑞都不肯讓步，只是要張去疏通和勸導曹錕讓步。
二十六日，張作霖沒耐性了，吩咐路局替他預備專車，準備離京，這一下段祺瑞受不了了。
二十七日，段親自到奉軍司令部來見張，挽留他不要離京。
段表示靳雲鵬堅決不肯復任總理，這一來內閣勢必改組，全班人馬都需要調動，安福系三總長自然隨之下臺。新內閣中，至少交通總長要保留，這是他們的底線。
此前，張作霖曾和靳雲鵬密談過，靳表示自身若再留任國務總理，必無良好結果，因此拜託張作霖不要再挽留他。張了解靳的處境，決心放棄挽留靳任閣揆的努力，因靳的去職，三總長自然也跟靳去職，問題確實是隨之而解決。
於是，內閣問題又集中到新內閣總理的人選，經過相關方面協商，多數人主張周樹模出來組閣。
二十九日，徐世昌邀請段祺瑞和張作霖兩人到公府舉行會商。就保定會議所提出的五項條件，徐提出折衷意見，主要是安福系三總長退出內閣，解除徐樹錚西北籌邊使和西北邊防軍總司令職務，所部改歸陸軍部直轄，新內閣由周樹模出組，靳雲鵬仍擔任陸軍總長。
當場段祺瑞基本沒怎麼說話，也沒有對這些問題發表意見。
第二天，段祺瑞召集安福系重要人物，討論先一天在公府會議的情形。徐樹錚等人這時為了自身生存問題，堅決主張採取強硬態度。
徐樹錚強調：三總長不可以退出內閣，最大讓步只能接受把西北邊防軍改歸邊防督辦直轄，他本人必須留任西北籌邊使。
小徐看著在一旁一直閉目凝思的段祺瑞，沒有人比他更瞭解段是多麼的意氣用事。
便用挑撥的口吻說：“如果超過這個限度，就是不替督辦留餘地，而我輩今後也抬不起頭來了。”
聽了小徐這番話，段使勁地把桌子一拍，大吼道：“對，我們不能再退了。他們欺人太甚。”
張作霖聽說段祺瑞態度又轉為強硬，便又跑到團河來向段告辭。
這次段變了臉，不待張開口便咆哮地說：“吳佩孚區區一師長，公然要挾罷免邊防大員，此風一開，中央政.府威信何在？徐樹錚不費一槍一彈收復外蒙，有什麼地方對不起國家，一定要他去職，分明是給我難堪，太欺負人了。你們一定要他去職，必須同時罷免吳佩孚！”
保定方面聽說西北邊防軍準備改歸邊防督辦直接統轄，認為是換湯不換藥，皖系毫無誠意，不止是敷衍，簡直是玩弄直系，所以非常憤慨。
張作霖雖是一個老粗，但他粗中有細，且智慧超人。他了解問題的癥結在於“解除徐樹錚的兵權”，這不止是直系的願望，也是奉系的願望，如果小徐兵權解除，其他條件便容易談了。
可這卻是最難讓段祺瑞接受的，當年為了小徐，段不惜和他受恩深重的老長官袁世凱反目，今天自然不會為了對直系讓步而犧牲小徐。
段的為人剛愎自用，自信自專，這些都是張作霖所瞭解的。他自己感到調和已不可能，所以三十日他又備車要離北京。
這次不是段留他，而是徐世昌留他，徐世昌認為張作霖一走，戰爭便無可避免，所以再三再四挽留，請張再作最後的努力。
但是，局勢已經走進死衚衕。小徐不但沒有犧牲自己挽救大局的胸襟，反而從中作梗，安福系更是變本加厲。在這樣情勢下，張作霖縱有三頭六臂，也無力迴天了。
七月一日，保定發表了直軍將士告邊防軍、西北邊防軍將士書。
言道：“直軍全體將士致書於邊防軍、西北軍全體將士曰：我輩誼切袍澤，情屬手足，謹抒親愛懇摯之宣言，敬告於明順逆知大義者，夫同類不相殘，同國無義戰，千古之鐵案也。我祖軒轅氏制兵之始，原為對外之用，北逐葷粥，南驅苗蠻，中原始有此一片乾淨土。洎平北伐玁狁，西御氐羌，與匈奴、突厥、金、元、滿、蒙角逐中土，無非借我國軍，固吾圉也。充國屯田，德裕籌邊，天下有道，守在四夷。
“我國邊防軍、西北軍之設制，為對外禦侮之嚆矢，凡屬袍澤，疇不以手加額，踴躍三百，邊防有託，西北無憂矣。乃野心權利者，利用愚民政策，採取軍閥主義，擁我數十萬朔方健兒，以為同室操戈之用，不以防邊，而以防內，憑藉西北，討伐西南，直視我堂堂國軍，桓桓武士為一家之鷹犬。在昔專制時代，天子討而不伐，諸侯伐而不討。西南各省同隸版圖，既無賣國媚外之罪，又焉有侵凌討伐之理。矧共和國家，以人民為主體，人民並非欲萁豆之煎，軍閥偏欲表鷸蚌之持，剝我人民脂膏，以重苦吾民，耗我國家餉糈，以疲睏吾民。我國民何負于軍人，我軍人更何仇於國家。天良未泯，浩氣猶存，既非至愚，終當覺悟。孰甘為少數私人作牛馬哉？亞聖有言：‘民為貴，社稷次之，君為輕。’詩曰：‘戎狄是膺、荊舒是懲。’凡我軍人動作，均應以對外為主旨，以民意為依歸。是在我軍人有覺悟心，尤貴我軍人有辨識力。
“彼野心私利之徒，動輒曰服從命令，擁護中央。試問此項征討命令，是否出於元首本心？即令出自元首，是否本於真正民意。為治命耶？為亂命耶？稍有常識者類能辨之。挾天子以令諸侯，久為權奸之慣技。安福系跳梁跋扈，而指揮安福禍國者，惟徐樹錚一個。我昂藏七尺男兒，詎甘心供其驅使耶？彼安福系以路礦抵押外人，屈膝借債，豢養國軍以殘害同胞。我國軍不乏忠義之士，明達之人，孰肯為一黨一系效死命哉。上年魯案發生，我國軍有協力對外之熱忱。借債發餉，我國軍有不受外餉之義憤。全國軍人，聞風興起。……
“全國本屬一家，焉有南北之界？北洋原系一體，何有皖直之分？國軍同仇對外，又安有芥蒂之嫌？邊防軍創邊防之基礎，西北軍開西北之宏圖。我同胞方且崇拜之，敬仰之不暇，更焉有水火虞邪？此次直軍撤防，原為掃除禍國殃民之安福系，及倡亂賣國之徐樹錚。對於先進泰斗，同氣友軍，毫無挾帶惡感，及並峙對敵行為。乃彼少數奸人，自知無立足之地，故為捏造流言，慫恿當道，不曰與‘合肥督辦為難’，即曰與‘邊防軍西北軍構怨’，是等無意識之讕言，希圖妄施離間。我親愛友軍必不為其稍動。
“此後凡我軍人，遐邇一體，披肝瀝膽，敵愾同仇，耿耿此心，可對天日。外禦其侮，內息鬩牆，堂堂男兒，絕不墜其收買離間術中。……我邊防軍暨西北同袍果有能先我著鞭，驅除徐樹錚，解散安福系，以順人心，而慰民望者，則既可建擁護元首之大勳，更可全維持合肥之令名。非但所以愛元首愛合肥，亦即所以愛國家愛人民也。直軍願執鞭弭以從其後。他日曆史增榮，俾直軍得附邊防軍與西北軍之驥尾，則榮幸多矣。袍澤志士，盍興乎來！直軍全體將士敬告。”
民國九年七月二日，徐世昌正式下令批准靳雲鵬辭職。
靳在請假期間，國務總理是由薩鎮冰代理。靳辭職後，亦竭力推薦周樹模組閣，自己願意擔任陸軍總長。
靳的堅決求去，是因為安福系三總長遇事和他作對，而在直皖兩系磨拳擦掌，躍躍欲戰的局勢中，他感到左右作人難，更怕皖系以他為叛徒。
他之所以願意退居陸軍總長地位，是怕他不做，會給他的死對頭小徐騰出地方。
七月四日，徐世昌在總統府舉行特別會議，參陸處員均到。會議結果，決定西北軍改歸陸軍部轄。西北軍司令部即撤銷。徐樹錚開去籌邊使，改任將軍，遺缺由李垣署理。
散會後即由總統府擬定命令共有三項：
（一）特任徐樹錚為遠威將軍。
（二）徐樹錚應即開去西北籌邊使，留京供職，西北籌邊使著李垣暫行署理。
（三）西北邊防總司令一缺著即裁撤，其所部由陸軍部接收。