因為他並不喜歡馮保這個人，與馮保的關係也不好。
作為內閣首輔，他不願意讓一個和自己合不來的人來擔任司禮監掌印太監這種重要的職位。
高拱向萬曆皇帝推薦了陳洪和孟衝，但是朱翊鈞對這兩個人根本就不感冒。
他幾乎是已經決定了要讓馮保坐上司禮監掌印太監的位置，所以並沒有採納高拱的意見。
對於高拱推薦的人，朱翊鈞自然也是沒有重視。
馮保對於高拱也是恨之入骨。
原來馮保早就是提督東廠兼管御馬監事務。
在明穆宗朱載垕登基的時候，當時司禮監掌印太監空缺。
按照資歷應該馮保應繼任擔任這個職位，但是穆總朱載垕並沒有瞧上馮保。
不知道是因為覺得馮保沒有能力還是其他什麼原因，反正就是沒有提攜馮保當司禮監掌印太監。
見司禮監掌印太監空缺，時任大學士的高拱便推薦御用監的太監陳洪。
眼睜睜的看著已經到手的司禮監掌印太監的位子被別人拿走了，馮保心中十分的不滿。
但是他又不敢怎麼樣。
一個是大明皇帝，一個是內閣重臣，他沒有辦法。
馮保因此而開始忌恨高拱。
直到太監陳洪被罷免後，司禮監掌印太監的位置又空缺了出來。
按照道理，這次怎麼說也應該是馮保了。
但是高拱又出來搞破壞了。
這次高拱又推薦太監孟衝。
而太監孟衝原來是執掌尚膳監的，按理不可能執掌司禮監，就算是輪都輪不到孟衝頭上。
一連兩次，高拱阻止了馮保坐上司禮監掌印太監的位置。
這讓馮保心中開始對高拱更加嫉恨了起來。
很快，他就等到了萬曆皇帝朱翊鈞的上位。
而朱翊鈞也有讓馮保擔任司禮監掌印太監的想法，但是依然得到了時任內閣首輔高拱的拒絕。
不過最終在李太后和萬曆皇帝的支援下，馮保還是坐上了司禮監掌印太監的位置。
但是他跟高拱的樑子算是徹底的結下了，他也下定了居心要除掉高拱。
另一邊的高拱也想除掉馮保，因為他覺得馮保太囂張了。
一次上朝的時候，馮保居然站在十歲的萬曆皇帝龍椅旁不下去。
而是同萬曆皇帝一樣，高高在上的俯視著朝中百官。
馮保的這一舉動讓大明朝廷的官員們有些震驚了。
要知道，奉天殿的高臺之上那是代表著什麼。
那是代表著至尊無上、高高在上。
那是隻有皇帝才能夠涉足的地方。
其他人包括太監或者宮女，那都是要跪在上面的。
除了大明的皇帝之外，任何人也不能在上面站著。
可是馮保這個太監就這樣堂而皇之的站在了上面，跟沒事人一樣。
可見馮保內心深處的囂張和跋扈。
內閣首輔高拱當時就下了決心要將馮保給驅逐。
馮保不但掌管司禮監更是提督東廠，所掌握的權勢從宮內到宮外都有覆蓋。