朱由崧到了九江府以後，只象徵性地接受了一次文武百官的朝拜，就又採取以前的模式，當起了甩手皇帝，把朝野一切大權全部甩給了內閣首輔大臣馬士英。
馬士英當然高興，他最喜歡朱由崧這種「有位無為」的皇帝。
讓高起潛帶著小太監，多多準備美女和酒肉好好伺候，美女、太監加美酒加歌舞就是這位南明皇帝的全部。
但是左家父子當然不幹，以前在南京馬士英和阮大鋮權勢熏天，為所欲為，他們左家父子可以睜一隻眼閉一隻眼。
現在到了九江，到了他左良玉的地盤，輪流坐樁也該輪到他左良玉了，馬士英得靠邊站，現在馬士英的兒子也死了，錦衣衛指揮使的位置還空著，左家父子就盯上了這個位置。
因此左良玉和左夢庚以侯爺和太子太保的名義，要陪王伴駕，要當朝議政，要分馬士英和阮大鋮的權。
馬士英嗅覺靈敏，瞬間就聞出了異味，立即讓剛剛晉升為兵部尚書的阮大鋮掌管錦衣衛。
左良玉大怒，他跟馬士英本來就對頭。
以前馬士英近親繁殖，讓他的兒子江湖人士出身的馬鑾掌握錦衣衛，他們父子獨霸朝綱，左良玉就打算以「清群側」為名出兵南京，清的就是馬士英父子。
現在馬鑾死了，南京丟了，朱由崧成了逃亡皇帝，來到九江避難。可是到九江馬士英仍然一家獨大，竟然要扶殖阮大鋮。
而阮大鋮是幹什麼的？他是個毫無節操的閹黨餘孽！
說他毫無節操，因其本是東林黨骨幹，卻投降水火不爐的魏忠賢，成為反對東林黨的先鋒。
魏忠賢被崇禎清算後，阮大鋮受到牽連，因此趕緊見風使舵又要投靠東林黨，卻被拒之門外，一直在野多年。
東林黨恨透了阮大鋮，但馬士英卻將他視為寶貝，在南明妄加提拔重用，成了南明的權臣。
左良玉是東林黨的門生，是侯恂一手提拔起來的，當然跟馬士英和阮大鋮尿不到一個壺裡。
因此左良玉大怒，帶著手下大將氣勢洶洶闖進皇宮要見朱由崧說事兒。
但是馬士英老女幹巨猾，和阮大鋮帶著錦衣衛把左良玉給截住，以朱由崧身體受了驚嚇，龍體欠安為由，根本不讓左良玉父子接觸朱由崧。
說白了錦衣衛還在馬士英的手裡，然後朝野大事一切均由他這個內閣首輔說了算。
雙方在朱由崧臨時下榻的皇宮宮門口，劍拔弩張，差點兵戎相見。
多虧太監高起潛從中周旋，大臣張捷、高卓苦勸，左良玉帶著人才氣乎乎的離開了皇宮。
左良玉父子回家自己的府中，氣得摔盆砸碗直罵娘，「馬瑤草……我必殺之！」
左良玉立即命人請來了好朋友湖廣總督袁繼咸和湖廣巡撫何騰蛟商議對策。
但是出乎左良玉意料的是，這兩個昔日好友，現在全都不支援他了，而是反對他和馬士英搞內訌。
理由是現在天下大亂，盜賊蜂起，老主崇禎生死不明，大明朝如風口之燈，老百姓民不聊生，處在水深火熱之中。