臨離開前，根部殘黨清理了當晚他們行動的痕跡，這也是為什麼後來綱手調查藥師野乃宇死亡的時候找不到一點線索的原因。
絕望的藥師兜本想帶藥師野乃宇的“屍體”回到孤兒院，可讓他沒想到的是，藥師野乃宇當時還有一息尚存。
等根部殘黨走後，藥師野乃宇提著最後一口氣交給了藥師兜兩個卷軸，並告誡藥師兜不要管她馬上離開木葉。
藥師兜不明白為什麼藥師野乃宇要讓他離開木葉，但這是野乃宇的遺命，藥師兜選擇了乖乖聽話，趁著夜色離開木葉。
從木葉出來以後，藥師兜開啟這兩個卷軸，一個是穢土轉生，一個是一封寫給大蛇丸的信。
看到大蛇丸的名字以後，藥師兜當即決定前往音忍村，經過幾天的跋涉後，藥師兜在山中遠剛開始融合輝夜姬查克拉的時候到達了音忍村，把信交給了大蛇丸。
大蛇丸老過信後嘆了口氣，給了藥師兜龍地洞的通靈契約，並提出讓藥師兜就在音忍村。
藥師兜毫不猶豫的拒絕了，他想給藥師野乃宇報仇，不可能留在音忍村。
大蛇丸也沒有多說什麼，只是告訴藥師兜，他手中的另一份卷軸可能能幫他達成心願。
之後藥師兜就開始研究穢土轉生，四處尋找強者們的屍體。有一次在尋找屍體的時候，藥師兜遇到了危險，情急之下他通靈出了龍地洞的蛇幫忙。
正是這次通靈，讓白蛇仙人注意到了藥師兜，他用逆向通靈之術把藥師兜召喚到了龍地洞，傳授藥師兜仙術。
而藥師兜也沒有辜負白蛇仙人的期望，很快掌握的仙人模式。
學會仙人模式以後，藥師兜潛入木葉，調查那些利用暫時藥師野乃宇的人，最終藥師兜得知這些人都是曾經根部的成員。
有關根的事情當年在木葉鬧的沸沸揚揚，藥師兜自然也是知道的，他知道是山中遠剷除了根部。
所以藥師兜恨山中遠，恨他為什麼沒有把這些人全殺掉，因此藥師兜才會出現在第四次忍界大戰的戰場上，並站在山中遠的對立面。
看完這些記憶以後，山中遠沉默了，就像藥師兜所認為的那樣，當初確實是他放過了根部的那些各個家族成員，藥師野乃宇的死亡他也有一部分責任。
想到這著山中遠嘆了口氣，封印了藥師兜的查克拉，讓人把他帶下去了。
佐助見狀眉頭一皺：“遠大人，不殺了他嗎？他可是穢土轉生的施術者，這次忍界大戰有不少忍者是死在了他召喚出來的傀儡手上。”
山中遠擺擺手說到：“這件事等戰爭結束以後我會和你們解釋的，現在先把目光放到最後的決戰上吧！”
“最後的決戰？”
“嗯，按各個戰場的情況，區域性戰爭馬上就要結束了，如果我猜的不錯，敵人的高階戰力應該要行動了。”山中遠面色凝重說到。
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