藥師兜的記憶出乎意料的多，裡面還參雜著一些其他人的記憶山中遠費了很大的功夫才找到了和黑袍人相關的東西。
從藥師兜的記憶中山中遠得知了黑袍人叫大筒木柳式，來忍界的目的和原著中出現的那兩個大筒木族人一樣，是神樹果實。
不同的是，大筒木柳式因為不想引起六道仙人兄弟的注意沒有選擇對尾獸下手，而是把目標放在了輝夜姬空間裡培養白絕的神樹樹枝上。
而兩人結盟的原因則是因為藥師兜穢土轉生出了二代火影，在二代火影的幫助下，能找到輝夜姬留下的空間。
而且在結盟期間大筒木柳式已經在藥師兜的幫助下，將一個空間裡的神樹樹枝提煉成了一顆果實。
得到了大筒木柳式的情報以後，山中遠繼續探尋為什麼藥師兜會離開木葉。
經過多番尋找山中遠在藥師兜的腦海深處找到一份被他下意識封存的記憶。
山中遠開啟這份記憶知道了藥師野乃宇死亡的真相。
藥師野乃宇原本是根部的一名忍者，擅長情報蒐集和醫療忍術，在山中遠將團藏殺死以後，藥師野乃宇也恢復了自由。
對此藥師野乃宇十分高興，在藥師兜的記憶中就能看出那段時間的藥師野乃宇臉上一直掛著笑容。
可惜好景不長，團藏雖然死了，但繼承了團藏偏激思想的根部成員還在。
當初山中遠因為這些人中很大一部分都是各大家族的成員，所以沒有斬草除根，而是讓他們回到了自己的家族。
正是這些人中的一部分，聚集起來，利用他們的家族給孤兒院施壓，想要繼續控制藥師野乃宇為他們蒐集情報。
藥師野乃宇為了孤兒院選擇了妥協，此後她一直往返於木葉和各個大國之間，直到中忍考試的時候。
中忍考試巖忍村引爆了隱藏在木葉的起爆符，炸燬了木葉大量的建築，其中就包括根部殘黨存放收集情報的地方。
根部殘黨在很長一段時間都陷入了瘋狂，大約一年以後，藥師野乃宇歸來帶回了新的情報。
在看到情報的以後，根部殘黨又回想起了自己的心血被毀，於是他們把所有的怒氣都發洩在藥師野乃宇身上。
一夥人對藥師野乃宇惡言相向，可他們並不知道這一切都被藥師兜看在了眼裡。
在藥師兜眼中，藥師野乃宇就像他的母親一樣，從小照顧他長大，教他醫療忍術。
看到藥師野乃宇被人如此辱罵，藥師兜徹底爆發了，他悄悄從暗中走出來，凝聚出查克拉手術，想殺掉這些人。
藥師兜出手突然，根部的殘黨來不及躲閃，只能提起藥師野乃宇擋在自己前面。
就這樣，藥師兜的查克拉手術刀刺中了藥師野乃宇，藥師兜的情緒瞬間崩潰，開始不顧一切的衝向這些根部殘黨。
可惜的是根部忍者都是精英，藥師兜根本不是他們的對手，不過藥師野乃宇已經“死了”根部殘黨也不敢在木葉惹出太大的麻煩，因此他們沒有多和藥師兜糾纏很快就離開了。