方以智講完之後，朱由檢不禁拍手讚道。
如果說徐光啟是大明睜眼看世界的第一人，那在這位名臣離世之後，經過此次歐洲之行的鍛鍊，方以智將會成為當世當之無愧的大明對外第一人。
朱由檢獲悉，方以智為了能夠更好地與歐洲各國政要交流和接觸，在這近五年的時間裡，已經學會了法語與葡萄牙語，在平時能夠較為熟練地用法語與笛卡爾交流，這種語言上的溝通也促使兩人的關係得到迅速提升。
工欲善其事必先利其器。
方以智這種態度值得予以特別的誇讚。
“方卿上述言論甚合朕意！
方卿能於諸多細節中察端倪、識趨勢，如此思想遠超諸多世人！
卿以為，接下來我大明該採用何種舉措加以應對？”
在稍微誇讚幾句後，朱由檢提出了自己的問題。
他現在非常期待方以智提出的解決方案能與自己高度契合，那樣的話，自己的計劃就會增添更強的主動力。
“啟奏聖上，臣以為，我皇明若想不被趕超，那就當學其重視實用人才之培養方法。
臣建議設立專門學堂直至大學，從幼童少年中發掘並培育人才，教授其數學等相關知識，多多與歐洲相關方面進行合作交流，並將其定為長期之策，不因一時之成敗而止步不前。
長此以往，我皇明焉有不強之理！”
方以智從容施禮後給出了自己的答案。
“甚好！
卿可願意擔此重任？”
方以智的回答讓朱由檢非常滿意，這與他創立皇家理工學院的思路完全一致。
“若能遂君王之志，臣願用畢生投入於此！”
方以智躬身慨然道。
“好！
方卿可能不知，朕已創立皇家理工學院，其目的與卿別無二致！
既是卿願意為國育才，那學院祭酒之位便是卿的！”
方以智、鄭芝鳳陛見數日之後，聖旨發出。
方以智以禮部尚書銜出任皇家理工學院祭酒。
鴻臚寺卿李進番調任禮部左侍郎一職，其職位由鄭芝鳳以禮部侍郎銜接任。
與此同時，鴻臚寺升格為正三品衙門，署衙所需人才以及職官升擢，由吏部及鴻臚寺堂官議定。
出訪歐洲使團成員中病歿者入英烈祠祭祀，有親屬者領燒埋銀五百兩；使團官吏均升兩級，擔任使團護衛的錦衣校尉同例。
選派留學的孤兒都進入理工學院繼續學習，照顧他們的護從全部轉為學院吏員，俸祿照其他衙門人員例發放。
方以智、鄭芝鳳的正妻均獲五品宜人封贈，其餘人等每人賞銀一百兩。