大密度、大規模的彈劾，可以想象，毛文龍的日子很不好過。他多次上疏自辯：“為病變萬難彌息，臣命萬難保全等事疏：臣受數十疏捏謗以來，心如死灰！”
好一個心如死灰！可以說，朝中有人，再大的不法沒人說，朝中無人，就算守法也不能倖免！
等到袁崇煥橫空出世，他是進士出身，天生就看不起飛揚跋扈的武將（你要是象小顏這麼會做人，老袁也就暫時放你一馬，但要是放老袁巡撫福州，搞不好他也要斬了小顏），眼裡揉不得沙子的袁崇煥有了“毛文龍可用就用，不可用就殺了他”的殺毛之心。
不過他也知道東江鎮（皮島）的重要性，而且顏大少連續來信，勸阻他說：“……顧慮日後，不可不慎！”
袁崇煥以閱兵為名，乘船到達皮島，毛文龍前來會面。袁崇煥同他設宴飲酒、行樂，每每到半夜才罷，毛文龍沒有覺察袁崇煥的意思。袁崇煥同他商量更改營制，設立監司（就是由朝廷派監軍），毛文龍很不高興。
袁崇煥用離職返鄉勸說他，大概就是說：“你辛苦了，現在給個機會給你，你停職留薪，回家鄉享福吧！”
毛文龍回答說：“以前有這個意思，但現在只有我瞭解東部戰事，等東部戰爭完畢，朝鮮衰弱，可以一舉而佔有。”
聽聽，非你莫屬，領導是最不喜歡聽這種話！
最終袁崇煥以毛文龍犯了（不設監軍、欺騙君主、侵佔軍糧、劫掠商船、強娶民女等）十二條大罪為由將其拿下，請出尚方寶劍，斬了毛文龍！
接著分撥毛文龍計程車兵二萬八千人為四協，任用毛文龍的兒子承祚、副將陳繼盛、參將徐敷奏、遊擊劉光祚為首領。收回毛文龍的敕印、尚方寶劍，令繼盛代他掌管。
袁回到寧遠，把毛文龍一事上書報告皇帝，末尾說：“毛文龍作為大將，不是我可以擅自誅殺的，所以我謹席橐待罪。”
崇禎皇帝突然聽到這個訊息，大吃一驚，但想到毛文龍既已死去，當時又靠著袁崇煥，所以就以讚揚的態度下詔書褒獎他。
不久又傳旨公開毛文龍的罪行，用以穩定袁崇煥的心。
毛文龍既去，朝中東林黨彈冠相慶，而袁崇煥也是得意洋洋，自以為為國鋤了大奸，整個中國只有一個明白人，遠在東南地區的顏常武知道中國進入了多事之秋！
沒有毛文龍的牽制，只怕皇太極即將入寇北平了！
歷史存在著它的巨大慣性，不是你顏大少一個人所能螳臂擋車的！
顏常武站在窗前看著港口的戰艦群，思索著他該怎麼辦！
不，既定的方針不能改！
他叫道：“來人！”
“是！”
“請陳和彬來！”
財政官陳和彬到達，驚訝聽顏常武吩咐道：“立即去月港，貸款百萬銀元，再建六條戰列艦，明年底我們乘西北風進攻巴達維亞！”
又一條命令是甘輝返回臺灣，對於大陸之事，顏常武做起鴕鳥。
……
他想的是不管別人家裡的事，沒想到別人卻記掛著他，確切的是北平的崇禎皇帝，準備搞臺灣了。