他得以安穩的建設知行學府和良莊，並且暗中訓練軍隊。
在此期間，袁樹對知行學府做了很多“創舉”。
鑑於學生數量太大，為了保證教學質量，他建立了班級制度，將所有學生根據籍貫、年齡進行區分，以一個班為集體進行教學，確保每個學生都能得到差不多的教育資源。
另外，他還建立了學科制度。
除了心學和古文經學之外，他還建立了世界上最早的專業農學科、天文學科、地理水文學科。
他以致良知、助農、耕戰為良知的學派理念給這些學科站臺，表示學子不能只學經學，其他的東西也要學，國家需要的是多方面的人才，而不單單隻需要太學博士。
然後，他還重新理清了一心會和袁氏弟子、門生之間的關係，首創了有標準的“畢業”制度。
之前一段時間，知行學府成為了一心會的外圍組織，而在建寧五年的二月份，袁樹宣佈改制，把知行學府和一心會提到同樣的等級，知行學府是知行學府，一心會是一心會。
他意識到一心會是一心會，是他個人搶班奪權的政治軍事工具，而知行學府應該是為國家儲才的教育機構，不應該有太多的政治色彩。
所以他做出了改制的決定，把知行學府的地位提升到和一心會並行的層次。
對外則宣稱學如逆水行舟，不進則退，經過之前的事件，袁樹發現大漢學子的學術能力下降的非常厲害，這對國家是不利的，所以袁氏知行學府內需要採取全新的辦法來增強學子們的學術能力。
剛剛加入知行學府的人統稱為門生，門生只能在知行學府接受兩年的教育，兩年之後舉辦第一次升級考試，透過考試者就能成為袁氏弟子，並且獲得繼續接受教育的資格。
不能透過者在未來半年之內還有兩次補考機會，如果兩次補考都不能透過，就必須要離開知行學府，不能繼續作為袁氏門生而存在。
所以如果不努力學習，不奮發進取，那麼一個學子只有兩年半的時間可以頂著袁氏門生的頭銜，之後便不再擁有。
而透過者就自動擁有了終生的“袁氏弟子”身份，可以繼續接受教育，如果自己有什麼門路，也可以自行選擇前往他處謀生，不過袁氏弟子的關係不會改變。
至於沒有門路卻想要更進一步的人可以選擇繼續學習一年，一年之後就可以參加“畢業考試”，透過畢業考試的人，就能成為袁氏“高足”，成為真正的袁樹認可的親傳弟子，從此就能和袁樹本人高度繫結。
說人話就是，袁樹本人給你包分配，包工作，給你五險一金外加企業年金，你要是對自己的戶口不滿意，袁氏也能幫你重新落戶。
總之，你這輩子，袁氏管定了！
而與此同時，一心會和知行學府的成績不掛鉤，不產生什麼額外的聯絡，不存在透過不了畢業考試就不能加入一心會的要求。
袁樹的決定是隻要有心學基礎，進入過知行學府求學超過半年，都有資格申請加入一心會。
某種意義上來說，一心會是一些有野心但是學術能力不足的人的青雲之路。
對於袁樹的這個決定，從茂陵遷徙而來的一心會管理層進行過一些商議。
有些人覺得這樣做對一心會來說不是什麼好事，一心會應該招收更有才能的人，知行學府裡透過考核的高材生最為合適。
但是袁樹則表示不可。
知行學府是學府，學府自然要拿成績說話，但一心會是一個立志要改變世界的組織，是要重塑社會風氣、改變糟糕現狀的組織，這樣的組織就不能純粹用成績來說話。
否則今文學派和古文學派早就把現實世界變成大同世界了。
“一心會是一心會，知行學府是知行學府，之前只是權宜之計，現在一切都安定下來了，咱們也在雒陽站穩腳跟了，之前一些不合適的策略都應該有所改變。”
袁樹力排眾議，定下了這個決定，將知行學府和一心會分開來辦理，兩者之間不再有任何隸屬關係，成為平級。
 本章完