當魯魯修再次回到黑色騎士團時，心中充斥的唯有仇恨，他要向背叛自己的人復仇，向朱雀、查爾斯、修奈澤爾……
魯魯修手中擁有集合了全世界力量的Knightmare，修奈澤爾手中擁有巨量軍隊，還有威懾世界的武器——芙蕾雅。
混亂的戰爭在仇恨昇華中全面打響，卡蓮也被救出來，為了保護zero，卡蓮駕駛著紅蓮聖天八極式，在正面戰場獲得優勢，救下陷入危及的zero。
朱雀為了阻止這場戰爭，攜帶著芙蕾雅的發射器衝向魯魯修，準備以這個武器，威懾兩方軍隊，挽救戰場範圍內上千萬普通民眾。
生死攸關之際，本打算用於威懾的武器芙蕾雅，卻在魯魯修的geass“不能死”作用下，被控制的朱雀按下發射按鈕。
粉紅色的光芒掩蓋了戰場上的一切，沒有巨大的聲音，人們就像失聰了一樣，在悲哀的死之奏樂中，呆呆地“欣賞”死亡。
待一切平息，芙蕾雅波及範圍內的一切化為廢墟，只留下一個半球形的大坑，戰爭雙方各居一邊，驚魂不定地看著那巨大的彈坑，芙蕾雅巨大的威力，深深烙印在每一個人心中。
但戰場中有個人並未注意這些，因為他在乎的是公館裡的娜娜莉。
這場戰爭的起因，自私點說，其實就是魯魯修為了奪回妹妹。而芙蕾雅爆炸點正下方，便是娜娜莉所在的公館。
娜娜莉的“死亡”令魯魯修悲痛欲絕，政事方面也出現漏洞。修奈澤爾利用這個機會，親自來到黑色騎士團談判。
Zero的真實身份是個定時炸彈，在這關鍵時刻，魯魯修的行為就如同走鋼絲，布里塔尼亞繼承人身份一旦曝光，絕對能引發巨大海嘯。修奈澤爾這次來，目的就是提前引爆這場大洪水。
在黑色騎士團內部發生裂隙，出現不同意見時刻，修奈澤爾與黑色騎士團談判，並在“不經意”間透露出zero的真實身份，布里塔尼亞第十一皇子，魯魯修?vi?布里塔尼亞，同時又透露geass的訊息，往魯魯修身上潑髒水。
魯魯修的存在，是所有想往上走的政治家們地阻礙，而在芙蕾雅威懾下，不少政客覺得這場戰爭可能就要到此為止了。於是，為了戰後利益，為了滿足慾望，他們故意放出風聲，並縱容謠言四起。
不少人被謠言煽動，雖然有人認為這是布里塔尼亞人的陰謀，但大多數人都覺得這是真的。騎士團內部因此事，分裂現象愈發嚴重。
然而當沉浸在失去親人的痛苦中，許久不問政事的魯魯修被黑色騎士團和修奈澤爾的埋伏包圍時，他才從悲傷中醒悟過來，可一切都太遲了。
曾經並肩作戰的友誼，追隨身邊宣誓效忠的信任，共同的理想與目標，在權與利的面前竟然如此廉價，扇要、藤堂和布里塔尼亞的圓桌騎士……
國破家亡的仇恨，數以千萬記的人命，僅憑一番話語便有合作可能，而合作的基礎竟是建立在殺死領導人的基礎上，簡直可笑至極，但魯魯修笑不出，因為這件事給他上了最後一課——人心。
人心鱔變，非是欺騙與背叛，而是有目的的選擇。
人因慾望而活。
有的人喜歡權利，所以努力攀爬；有的人喜歡財富，所以努力賺錢……
不論他們的慾望是什麼，根源來自何方，現在，矛頭一同都指向zero。
現在的情況，已經不是可以解決的事了。關鍵在於geass這種控制人心的力量，是所有謀求利益之人渴望又害怕的東西，如果不能掌握在自己手裡，那麼就將其毀滅。
因背叛欺瞞而憤怒的平凡者、因渴望權勢而下絆的投機者、因智慧超群而懷疑的思考者、因同生共死而不離不棄的追隨者……