接上次劇情，也就是那個小國公主在一個工人小子的幫助下，她離開了小國的都城，且來到了鄉下。
之後的劇情，就是高貴的公主在貧窮的鄉下，且鬧出了很多有搞笑的事情。
在這期間，公主慢慢的從一個嬌生慣養的女孩成長為了一個懂事大體的女性。
然後，就在男女主角摩擦出感情，準備進行下一步的時候，成年了的黑龍賦予了公主叔叔，也就是新大名無窮的膽氣。
一時間，稱霸天下的宣告引來了全世界的敵視。於是，各式各樣的忍者前來討伐新大名了。
忍者的形象胖痩高矮不一而足，但是出場來看，這些忍者看起來都非常有氣勢。
當然，忍者的數量不可能真的和第二次忍者大戰一樣多。如果真的要還原，那劇組不得賠死。
所以，電影中出現的忍者的數量，其實也就幾十位而已。
拯救世界，是忍者的事情。稱霸世界，是控制黑龍的新大名的事情。這樣看來，無論結果怎麼發展，男女主角都不可能加入劇情中。
這樣怎麼行呢！？
所以，在討伐新大名的時候，那些強攻的忍者都被黑龍擊敗了。
其中，一個重傷的忍者來到了主角的村子。因為傷勢過重，忍者將自己的查克拉送給了主角。
隨後，男主角便自然而然的肩負起了拯救世界的大任。
因為擁有了查克拉，所以男主角被當成了忍者。
之後，在忍者們組織的一個秘密集會中，他們知道了一個訊息。那就是，想要打敗黑龍，就必須得到神石的力量。
而神石之中，除了一大塊因為吸收怨氣且變化而成的黑龍之外，還有一些神石的碎片散落在隕坑之中。
上一次的戰鬥，黑龍就是因為神石的力量，而被打敗的。為了再次打敗黑龍，眾忍者們決定，他們要去奪取神石碎片。
然而，新大名早就防了一手。落在隕坑內的神石碎片，早就被他收集了起來，且讓黑龍吞了下去。
沒辦法，唯一的弱點沒有了。但是，即便是這樣，為了天下蒼生，忍者們也只能硬著頭皮上了。
這邊，男主角和公主想要分別。但是，公主卻不願意他去送死。
一番爭執之下，二人從意見不合的鬥嘴，變成了乾柴烈火的鬥嘴。
黑屏一晚之後，男主角起身想要離開。不過，公主卻讓男主角帶上她。否則，她就自殺。
於是，沒有辦法，男主角只能帶上女主。
之後，再次集結了起來，忍者們抱著必死的信念和黑龍戰鬥著。
然而，沒有神石的力量，忍者們面對黑龍，簡直無力的不能再無力了。
雖然忍者們花樣很多，電影裡，各種特效層出不窮，動作酷炫帥氣（有焱提供指導）。但是，這些都無法讓黑龍有一絲絲的損傷。
隨後，戰鬥結果一邊倒，男主角被打的吐血，且倒在地上。
最後，眼看著黑龍就要殺死他們，為了保護男主，一旁小心觀戰的公主站了出來，她想要用自己和黑龍過去的記憶，來喚醒它的理智。
不過，新大名的命令已經根深蒂固了，黑龍被新大名命令了一下，就直接抽飛了公主。