二公子聞知，非常害怕，三十六計走為上，重耳逃往蒲，夷吾逃往屈，加強防備，嚴陣以待。
當初，獻公派大夫士芳為為重耳和夷吾二公子修築蒲、屈二城，不小心，在城牆裡放進了柴草。但沒修成。
夷吾把這事報告給獻公，獻公對土芳大光其火。
士芳謝罪道：“臣下聽說，沒有喪事而悲傷，憂愁必定變為仇怨。沒有戰事而築城，仇敵必定來佔領。既然仇敵會來佔領，又何必那麼謹慎呢？在官位而不接受君命，這是不敬，加固仇敵的城池，這是不忠。失去了恭敬和忠誠，拿什麼來事奉國君呢？《詩》說：‘心懷德行就是安寧，同宗子弟就是堅城。’國君如果能修德行並鞏國宗子的地位，有什麼城池比得上呢？三年之後就要用兵，哪裡用得著那麼謹慎？邊境少有敵寇來犯，築城有什麼用？”
退朝後，自己作歌道：“狐狸毛的皮衣亂哄哄，一個國家三個公，弄得我無所適從！”
終於把城修完了。申生死後，這兩座城還真派上了用場。
獻公聽說二公子不辭而別，氣不打一處來，果然他們與太子有預謀，便發兵攻打蒲城。
蒲城城主勃鞮得得到要殺死重耳的命令，於是敦促重耳快快自殺了事。
重耳聞言偷偷跳牆逃走，勃鞮急忙追過去，結果一劍斬斷了重耳的衣袖。
重耳死裡逃生，跑到了屈城，獻公派人討伐屈城，屈城嚴加防守，沒能攻下。
魯僖公六年的春天，晉獻公派賈華去攻打屈城。夷吾堅守不住，與屈人訂立盟約後出走。夷吾準備逃往狄國，卻芮道：“你在重耳之後逃到狄國去，這證明了你有罪，不如去梁國。梁國靠近秦國，而且得到秦國的信任。”於是夷吾去了粱國。
重耳與狐偃、趙衰、顛頡、魏犨、胥臣等人一起流亡到翟國，其中狐偃是重耳的舅舅，翟國也是狐偃的祖國，此時翟人正在和廧咎如打仗並俘獲的兩個姑娘，翟人把這兩個姑娘送給了重耳。重耳娶了其中一個叫季隗的姑娘，生了伯鰷和叔劉，另一個賜給了趙衰。
晉獻公二十六年九月，晉獻公去世。
秦穆公派子顯慰問重耳：“寡人聽說，失去國家常常在這個時候，得到國家常常在這個時候，雖然您恭敬嚴肅，居喪也不可太久，時機也不可失去啊，請考慮一下吧。”
重耳將這事告訴舅舅狐偃，狐偃說：“你還是推辭吧。居喪之人沒有值得寶貴的東西，可珍貴的只有仁愛和親情。父親死去這是何等重大的事情啊？還要用這事來謀利，那麼天下誰能說清我們無罪過啊？”
重耳便對秦國客人道：“君王賞臉弔唁流亡的重耳，我在父親死去居喪的時候，我不能參加喪禮中去，而讓您
操心了。父親死去這是何等重大的事情啊？我哪裡還有其他的圖謀來辜負您的情義啊？”
重耳行稽顙之禮但不拜謝秦國客人，哭著起身，起身後但不再跟秦國客人私下交談。
子顯覆命將事情告訴秦穆公。秦穆公道：“仁人啊，公子重耳！叩拜但不拜謝，是他沒已晉獻公的繼承人而自居，所以沒有拜謝。哭著起身，就表示敬愛父親。起身但不私談，就表示遠離個人利益啊。”
晉獻公的去世後，公子奚齊繼位，驪姬為國母，荀息為託孤之臣，一直支援太子申生的晉國卿大夫裡克、邳鄭父等人趁機聚眾作亂，把幼主奚齊刺死在晉獻公的靈堂上，之後荀息立卓子為晉君，裡克等人把卓子刺殺在朝堂之上，又將驪姬活活鞭死。
裡克等人派狐偃之兄狐毛至翟國迎接公子重耳，打算擁立他。
重耳辭謝道：“我違背父親的命令逃出晉國，父親逝世後又不能按兒子的禮儀侍候喪事，我怎麼敢回國即位，請大夫還是改立別人吧。”
於是裡克讓人到梁國去迎接夷吾，夷吾的謀臣呂省、郤芮認為裡克不讓晉國國內的公子為國君，反而尋找流亡在外的夷吾，難令人信服，就商量以河西之地換取秦國支援夷吾歸晉，並允諾夷吾為君之後以汾陽之邑封予裡克。
晉惠公元年，夷吾即位，史稱晉惠公。
晉惠公即位後，違背了給秦和裡克的約定，又殺死了邳鄭父與七輿大夫，晉人認為夷吾言而無信所以對他都不順服。
晉惠公八年，晉惠公恐晉國人依附重耳，就派勃鞮追殺重耳。
在翟國住了十二年的重耳聞訊就與趙衰等人商量說：“我當初逃到翟，不是因為它可以給我幫助，而是因為這裡距離晉國近，容易達到，所以暫且在此歇腳。時間久了，就希望到大國去。齊桓公喜好善行，有志稱霸，體恤諸侯。現在聽說管仲、隰朋去世，齊也想尋找賢能的人輔佐，我們為何不前往呢？”
於是，重耳又踏上了去齊國的路途。
離開翟時，重耳對妻子說：“等我二十五年，我不回來，你就改嫁。”
妻子笑著回答：“等到二十五年，我墳上的柏都長大了。雖然如此，我還是會等著你的。”
重耳一行先是來到了衛國，衛文公看他落魄沒有好好的招待他們，他們就離開了衛國。
一路走到了河南濮陽東南五鹿時，重耳餓得實在沒有辦法，就向沿途的村民討要點吃的，村民看到他那落魄的樣子，就給了他一塊土讓他吃。
重耳大怒，趙衰安慰他說：“土，象徵土地，他們是表示對您臣服，你應該行禮接受它。”
重耳拜謝村民並把土塊裝在車上去往齊國了。