孤島監獄發生的事情，也在S..L.D.控制的其他區域上演著。
在被兩支特殊反應部隊突然襲擊的幽靈基地此時已經亂作一團。
大部分S..L.D.特工們還活著，而且他們還在堅守，在努力的反擊著入侵者。
但因為內部通訊被切斷，而且幽靈基地實在太過龐大的緣故，他們只能各自為戰。
誰也沒料到原本宣稱來接管幽靈基地計程車兵們會對這裡展開屠殺，在特工們打算啟動幽靈基地的防禦體系之前，第一波被突襲的通訊系統已經落入了九頭蛇計程車兵們手裡。
此時，一隊特工正在指揮官的帶領下，死守在通往地下監獄的通道中。
幾臺堡壘機器人已經被啟動，在這寬大的通道前方，也已經佈滿了屍體。
那些九頭蛇試圖衝入地下監獄，但是在火力全開的堡壘機器人組成的火力網中，他們哪裡也去不了。
“總部還沒有回應嗎？”
指揮官抓著脈衝槍，對身後的特工問到：
“科爾森和梅琳達的私人電話也沒有反應？”
“是的，完全打不通。”
在他身後，一臉緊張的年輕特工手裡抓著通訊器，他對自己的長官說：
“他們從內部切斷了通訊網，地面上的同伴最後一次聯絡還是在17分鐘前...”
“沒人會來支援我們了，長官，我們被困在這裡了，我們完了。”
“閉嘴！”
指揮官咬著牙，對剩下的人說：
“你們都是S..L.D.的老特工了，你們都和梅林長官一起共事過，堅持下去！他一定會來支援我們的！”
“就和之前無數次一樣...他從不會讓我們失望的，我們必須...”
“砰”
正在給其他人打氣的指揮官的話還沒說完，他頭頂的磚石就在塵土四濺中爆開。
一個人影在煙塵四濺中落入了人群裡。
眼疾手快的指揮官立刻調轉槍口，試圖射擊，但那傢伙揮起手，在火星四濺中，黑色的爪子就將銀灰色的脈衝槍從中間切開。
連帶著指揮官的軀體也被那異化的爪子切開。
在鮮血四濺中，其他的特工紛紛開火，子彈橫飛，幾臺被啟用的堡壘機器人也調轉槍口，但它們並沒有立刻開火。
因為在敵我識別系統中，這正在瘋狂屠戮的傢伙，是S..L.D.的內部人員。
那衝入人群大開殺戒的傢伙似乎知道這一點，他根本不理會身後的堡壘，面對眼前飛來的子彈，他不閃不避，頂著攢射的子彈就撲了過去。
幾分鐘之後，僅剩下的最後一名特工逃入了地下監獄的拐角，他身上沾滿了鮮血，手中扣著通訊器，另一隻手裡提著手槍，他年輕的臉上滿是惶恐。
他剛剛入職不到3個月，就遇到了這種事情。
長官和同時慘死在他眼前，還有那個怎麼也打不死的怪物。
那些鮮血，慘叫，這一切都讓這個年輕人手足無措。
他靠在拐角處，緊張的看著四周，周圍安靜極了，他甚至能聽到自己的心跳聲。
“嘶、嘶”
他手中的通訊器傳來一絲雜音，這年輕人立刻將通訊器放在耳邊，在調整頻率之後，他終於收到了其中發來的訊息。
“幽靈基地的同事們，我是你們的長官菲爾.科爾森！”
“因為目前在發生的事情，我宣佈S..L.D.進入緊急狀態。”
“如果你收到了這條命令，請立刻通知你的同事，棄守基地，以最快的速度撤退到C7號地下通道！在那裡將有人接應你們離開！”
“重複一次，棄守基地，立刻離開！”