此次清虛從太上老君哪裡不僅是借來了兩儀微塵陣，而且還借來了屠巫劍，此劍乃是帝俊為殺祖巫而造，專克巫人，不過由於此件煞氣極重所以清虛並沒有直接將屠巫劍交給軒轅，而是先用秘法重新祭練了一次屠巫劍，這一練便是九九八十一天。
軒轅自得到清虛相助之後便駕雲向有熊部落飛去不日便已到達。軒轅降下雲頭走進議事廳便著召集眾臣來議事。眾臣聞軒轅已回且相召議事忙丟下手中之事向議事廳趕去軒轅待眾臣到齊便說道：“老師青華已然應允到時相助擋住刑天等三位大神通者我等可即日興兵以圖一戰而定蚩尤還天下百姓以安寧。”眾臣聞言大喜忙各自去準備不日大軍便整裝待軒轅在起兵前祝告天地曰：“今有九黎部落領蚩尤羶起刀兵屠戮萬民今我欲討之蒼天保佑我等一戰而定。”
軒轅再次領大軍討伐蚩尤蚩尤得知後大怒言道：“軒轅小兒屢犯我疆境我還未曾伐他他到先來攻我今定不讓他生還。”說完也盡起大軍向軒轅迎去雙方在涿鹿相遇擺開陣勢一通大戰卻是誰也奈何不了誰。蚩尤見狀對幾位大巫說道：“還請諸位兄弟助我。”眾大巫應道：“理當相助。”說完便各使神通向軒轅殺去軒轅身後一眾修士也是各展神通向幾位大巫殺去雙方卻是再次僵持。蚩尤轉身對刑天、風伯說道：“還是要請二位大人和雨師兄弟出手擊敗軒轅帳下一眾修士以便我軍戰勝軒轅。”刑天、風伯、雨師點頭允諾隨即和雨師向軒轅陣前殺去。
就在此時刑天三人聽見一個聲音說道：“三位都是有大神通之人當知巫妖二族隕落人族大興乃是天數又何必助蚩尤與軒轅作戰平白惹上因果。”刑天等三人聞言停下身形看去只見一身穿月白道袍頭戴紫金九宮冠的道人擋在三人身前。刑天仔細一看正是清虛道君。
刑天開口說道：“清虛你欲相助門下弟子直說便是又何必拐彎抹角說些廢話。”清虛聞言臉上微微一紅隨即又說道：“刑天大巫卻是爽快之人那貧道也不在做作。不錯貧道上次幫的，這次也幫的，你巫族本就應該在上次大劫中隱去，如今還不知悔過當心滅族之禍。況且這是人族之事與你巫族又有什麼關係”
刑天冷聲說道：“那蚩尤乃是我巫族大巫又怎會與我等無關。今日你欲相助弟子我等也不會罷手還是做過一場再說。”
清虛道：“貧道本不欲與三位為敵奈何三位卻是執迷不悟。”
刑天大笑道：“清虛我也曾聽過你的威名知道你神通廣大號稱聖人之下第一人今日我三人就來領教道君手段。”
說完便操干鏚與風伯、雨師一起向清虛攻去。
清虛見狀忙一推頂上九宮冠只見腦後現出一斗大的功德金輪五條清氣翻轉而上在清虛頂上形成一半畝大小的慶雲慶雲之上三朵斗大的青蓮浮於其上青蓮之上託著一高萬丈的玲瓏寶塔。只見清虛伸手一指刑天三人喊了一聲“去”就見那被青蓮託於其上的天地玄黃玲瓏寶塔從慶雲之上飛下飛至刑天、風伯、雨師三人頂上絲絲玄黃之氣垂下將刑天三人困於其中這天地玄黃玲瓏寶塔乃是天下一等一的防守至寶用之困人卻也是無往而不利。
刑天三人見自己被玲瓏寶塔所困忙各自顯出原身意圖將天地玄黃玲瓏寶塔打破只見刑天化為一千丈高渾身經脈盤結的巨人左手握著長方形的盾牌右手拿著一柄閃光的大斧一下下向玲瓏寶塔砍去；風伯口中噴出一團團的死氣向寶塔上垂下的玄黃之氣飄去；雨師口中噴吐著毒液以圖將玄黃之氣腐蝕穿透。
可天地玄黃玲瓏寶塔作為後天第一功德之物天下一等一的防禦至寶又怎麼會輕易被破只見道道玄黃之氣絲絲垂下連綿不絕。刑天三人怎麼都打不破天地玄黃玲瓏寶塔的防禦清虛又見風伯、雨師噴出的都是不潔之物怕汙了自己的寶物便有把頭頂一拍只見清虛頂上原本斗大的功德金輪變得巨大無比將天地玄黃玲瓏寶塔整個罩在其中風伯、雨師噴出的死氣和毒液被功德金光一照立馬化為無有。而清虛在將刑天等三位大巫困住之後卻也不在攻擊只將其三人困住不讓他們出去相助蚩尤。
蚩尤先前見刑天三人被清虛道君所阻便知此戰刑天三人已然指望不到便不再去看清虛與刑天之戰只專心指揮和軒轅作戰而此時雙方卻是僵持不下誰也無法勝出蚩尤見狀便將他一直雪藏的由一眾小巫和巫人組成的巫族數萬大軍派出只見巫族大軍個個勇猛無比且其身上都有法力軒轅的軍隊卻不是對手一下便落於下風軒轅見狀大為著急但卻也是無法可想眼見軒轅大軍即將落敗。
突然從九天之上降下一金甲神人領著數萬天兵天將從天而降將巫族大軍擋住廝殺那神人轉對軒轅說道：“小將奉上聖白玉龜臺九靈太真無極聖母瑤池大聖西王金母無上清靈元君統御群仙大天尊（瑤池金母）之命前來相助人皇。
說完便領著一眾天兵天將向巫族殺去軒轅麾下眾將士見天母派兵相助自己一放頓時士氣大振而蚩尤一方卻是士氣低迷軒轅見狀忙揮陣一陣掩殺將蚩尤九黎部落戰士殺的大敗而天上玉皇所派之天兵天將也將巫族大軍殺敗。
蚩尤見狀不妙忙向遠方逃去巫族一眾戰士見蚩尤已逃便也一轟而逃幾位大巫也是見勢不妙轉身逃向遠方九黎部落的戰士見大家都逃了便也開始逃跑終於演變成大潰逃。
軒轅見九黎大軍已敗忙揮軍掩殺眾士卒個個奮勇向前將九黎大軍打得潰不成軍而軒轅也帶著一眾練氣士向蚩尤追去蚩尤見無法逃脫便轉身接戰只見眾位練氣士圍著蚩尤一陣狂攻蚩尤不能抵擋忙轉身而逃軒轅眾人也是繼續追想要將蚩尤抓住。
每次當軒轅和一眾練氣士快要追上之時蚩尤便放出蚩尤旗抵擋一陣自己轉身就逃如此眾人追不上蚩尤也逃不脫。軒轅極為煩惱。就在這時從三十三天之外飛來一枚紅繡球砸在蚩尤身上將蚩尤打暈眾人忙上前將蚩尤按住因巫族肉身神通無雙眾人便欲將蚩尤琵琶骨穿透廢其神通以便關押可那蚩尤乃是大巫之身一身筋骨直如精鋼一般眾人皆是束手無策。
就在沒有辦法之時，軒轅想起了，清虛道君賜予自己的神劍，一劍之下，蚩尤當即被穿刺鎖骨穿上龍筋並捆綁一番送回大軍陣中關押。