1500年前，人類在火星上建立墨涅洛菲城。這是人類記載下的最初的歷史。和它同時被記載下來的是人們在建造墨涅洛菲的時候，從地下挖出了一本筆記本，上面記載了人類來自於地球。從那時開始，火星上的人類才知道原來地球是他們最初的家園。但是它又引發出了各種疑問：地球在哪裡？人類為什麼要從地球遷徙到火星上居住？墨涅·卜弗的筆記本被測定出在地下埋了500年，那麼這段消失的500年曆史中究竟發生了什麼？
墨涅·卜弗的筆記本揭開了人類最根本的問題，人們為了紀念墨涅·卜弗，將在其上建造的城市和國家命名為墨涅洛菲，並封他為墨涅洛菲的第一位皇帝。更有人將墨涅·卜弗視作終生信仰，便有了真教。真教的建立在火星的歷史上共出現過兩次。一次是墨涅洛菲城建立後由原住民之間形成的原始真教，而在這之後，一位聲稱是墨涅·卜弗轉世的人的出現，使得真教走向分裂。原先建立的真教被稱為墨真教，而後來圍繞轉世者的真教被稱為蘇真教。墨真教拒絕承認卜弗的轉世者，他們稱他為騙子和褻瀆者。而蘇真教則據理力爭，極盡全力維護轉世者身份的合法性。雙方都堅稱自己是墨涅·卜弗的正統繼承者，為此墨真教和蘇真教爆發了持續近200年的戰爭。
就在墨真教和蘇真教戰爭爆發百年之際，墨涅洛菲皇室迎來了一位王族繼任者，他就是墨涅·皇·卜隆。在他十歲左右的時候，帝國就已經搖搖欲墜。當時反帝國的聲音已經出現在了墨涅洛菲，共和的願望正在人們心中滋生。在卜隆的眼裡，父親的形象總是嚴肅，強硬，傲慢和堅強的，直到有一天他看見他的父親不再威武，不再大聲嚷嚷，不再傲慢無禮，而是一具父親的屍體。
卜隆的父親是被人暗殺的。兇手一直都是一個謎。有傳言說他是被墨真教信徒暗殺的，因為卜隆的父親曾公開支援蘇真教的教義，批判墨真教是過時的宗教。還有傳言說他是被共和黨暗殺的，但是皇室出面極力否認這一說法，並且一再堅稱卜弗宮的安保是不存在任何問題的。最後一種傳言說他是被自己的近臣暗殺的，因為當時大臣中也有部分是主張共和的，他們希望皇室只是作為一種國家象徵，但卻遭到了卜隆父親的嚴厲指責和抵抗。
之後卜隆繼承皇位，雖然他貴為一國之君，但是依然是在墨真教、共和黨和近臣的夾縫中生存著。他父親的死教會了他在這個世界上立足和生存的法則。忍耐，成為了他一生的座右銘。
終於，這份臥薪嚐膽在他二十歲那年得到了回報。撒多幕向墨涅洛菲宣戰，卜隆率領兩萬精銳擊退侵略軍並且收復德薩區，這場勝利為卜隆和皇室帶來了榮譽，墨涅洛菲到處都是帝國勝利的喜悅。
然而之後卜隆性格大變，一改曾經謹言慎行的作風，大興軍工業，研製軍事科技，在墨涅洛菲的各個區域建造軍工廠，雖然大臣們表面不做聲，但是心裡都知道他們的皇帝正在走軍事集權的道路。
墨真教和共和黨人因軍事集權而受到打壓，共和之路走得極其艱辛和曲折。卜隆則加速他的集權專政，弱化共和的影響力，希望就此消滅共和黨，並且重新拉攏墨真教。但就在墨涅洛菲人為他們的皇帝歌功頌德，奏樂歡唱的時候，鄰國蒂亞提斯向墨涅洛菲宣戰。
有人說正是這場戰爭葬送了墨涅的末代皇帝。卜隆率領部隊在拉瓦吉古和蒂亞提斯軍交戰，兩天兩夜持續暴雨使得戰爭殘酷而膠著，這令皇室感到不安。在黑暗處蜷縮著的共和黨拉攏了墨真教在城中活躍起來，共和的聲音出現在墨涅洛菲的大街小巷。
而就在此刻，撒多幕單方面撕毀與墨涅洛菲的停戰協定，並向墨涅洛菲發動猛烈攻擊。這一舉動出乎所有人的意料。皇室緊急集合城中軍民六十八萬人進行軍事抵禦，這就是70年前著名的墨涅洛菲保衛戰。
卜隆為了回軍援救墨涅洛菲，和蒂亞提斯簽訂了停戰協定，割讓拉瓦吉古。然後率軍衝向墨涅洛菲。大火，戰爭，瘟疫，恐慌，墨涅洛菲正在枯萎，六十八萬人稍縱即逝，就在這最危急的時刻，墨涅洛菲等到了援軍。
在卜隆率領的援軍的保衛下，最終墨涅洛菲獲得了勝利。可是帝國卻已經走到了盡頭，墨涅大革命爆發，共和黨人佔領了卜弗宮。墨真教信徒們叫囂著“異教徒”、“賣國賊”和“拉瓦吉古的罪人”一哄而上逮捕了卜隆，半小時後，卜隆及其皇室成員在卡梅廣場在墨真教信徒們的辱罵聲和歡呼聲中被處死。
卜隆死後，墨涅洛菲進入共和。
墨涅的第一任執政者是共和黨的領袖墨涅·克拖夫。無論是革命還是建國都需要大量的資金，克托夫依靠著豐厚的家底坐上了共和黨領袖和執政者的位置。克托夫在位時，安卡西魯和撒多幕正在交戰，墨涅洛菲並無戰事發生。國內由於大革命剛剛結束，所以人們都期盼安定生活。
墨涅的第二位執政者是克托夫的侄子墨涅·萊特。他是公認的善辯者，辯論是他的強項。他說服了安卡西魯與墨涅洛菲簽訂同盟協定，共同進退宣告。萊特在位時，配合安卡西魯向撒多幕發兵，收復了德薩區和阿布索，搗毀了蘇真教在沃蘭的據點。國內由於挫敗了蘇真教在南方的影響力而獲得了墨真教的支援。
墨涅的第三位執政者是墨涅·維基。他是從撒多幕的監獄裡逃出來的。回到墨涅洛菲後獲得榮譽和優待，升至黨政司，兩年後，成為墨涅·萊特的副官。萊特任期過後，推薦他為新執政者。