馬士英並未直接進入四川，從潼關直接南下進入湖廣的鄖陽，與在鄖陽等候的鄧世秋，以及從鳳陽趕赴鄖陽的鳳陽總兵程仲地會和，兩路大軍會和之後總兵力達到了十萬人，從兵力配置方面來說，馬士英率領的五萬大軍屬於生力軍，所有軍士都經歷了馬欄山之戰的慘烈廝殺，彰顯出來強悍與殺氣，鄧世秋與程仲地率領的五萬大軍主要為原湖廣總兵左良玉麾下的軍士，雖然經歷了幾個月的淺黃訓練，但絕大部分軍士都未經歷過慘烈戰鬥的磨礪，單從戰鬥力方面來說要差一些。
兩路大軍會和之後，馬士英明白了皇上的良苦用心，自崇禎十三年以來，張獻忠變開始進入四川作戰，導致四川各地局勢大亂，期間張獻忠轉戰湖廣和南直隸所轄廬州等地，崇禎十七年正月再度進入四川，先後攻克重慶和成都等地，四川巡撫龍文光等官員因不願意投降，被張獻忠盡數斬殺，封地在四川的藩王朱至澍、朱至淥自殺，張獻忠在成都稱帝，國號大西。
張獻忠對四川各地的統治異常殘酷, 所佔領的地方, 士紳富戶要麼全部逃離，要麼幾乎被斬殺殆盡，至於說各地的反對力量，更是不遺餘力的剿滅和斬殺, 以此來穩定四川的局勢。
四川總兵秦良玉、參將楊展在諸多士紳富戶的支援下, 率領少量的兵力與張獻忠周旋，大明京城被李自成攻陷、崇禎皇帝自縊身亡, 給予了秦良玉和楊展等人沉重的打擊, 四川地方計程車紳富戶在局勢不明朗的情況之下，各自為政, 逐漸開始不聽從朝廷的號令。
朱慈烺登基之後, 四川總兵秦良玉、參將楊展先後寫去了效忠的奏摺，不過逐漸積聚起來力量的少量士紳富戶，對於朱慈烺和朝廷沒有多大的興趣，他們一門心思想著打敗張獻忠, 確定下來自身的勢力範圍, 而且他們冒天下之大不韙, 居然敢於暗算和斬殺朝廷任命之官吏。
皇上專門抽調強悍的生力軍進入四川, 目的就是徹底打敗和剿滅張獻忠, 狠狠打壓那些不知道天高地厚、各自為政計程車紳富戶。
馬士英明白自身的重任, 他這個四川總督, 接下來恐怕也竭盡全力, 一方面務必要徹底剿滅張獻忠, 另外一方面也要完全穩定四川的局勢，清除那些狂傲計程車紳富戶。
馬士英很聰明, 他詳細分析和揣摩了皇上的所有話語，從中還是悟出了一些東西, 譬如說究竟要怎麼樣對待四川計程車紳富戶，哪些士紳富戶應該被抄沒家產, 如何對待張獻忠任命的地方官員，是不是全部都要斬殺, 如何保證四川的局勢能夠真正穩定下來, 要知道四川經歷了張獻忠的蹂躪和部分士紳富戶的囂張，朝廷確立的制度蕩然無存，朝廷任命的官吏損失殆盡，絕大部分的財富集中到張獻忠的手中, 包括部分計程車紳富戶手中，接下來穩定四川的局勢肯定需要消耗錢財, 朝廷不可能撥付多少的錢糧, 這就要依靠他這個四川總督來想辦法。
馬士英牢牢記住了一點，自己不伸手拿一文錢，繳獲的錢糧全部用於四川地方，用力大軍征伐的開銷，這樣肯定沒有問題，至於說其他方面，皇上亦說過一句話, 治亂世須用重典, 當下的四川不就是這樣的局面嗎。
四川道路艱險，蜀道難, 難以上青天，這不僅僅是說四川境內道路難行，包括進入四川的道路都是異常險峻的, 北面毗鄰陝西漢中，秦嶺橫亙其中，南面與雲南、貴州接壤，雲貴高原擺在面前，東面與湖廣鄖陽、施南宣府司等地接壤，武陵山阻斷了交通，至於說東面，則是與烏斯藏都司接壤，那是稱為雄鷹都飛不過去的地方。
所以如何神不知鬼不覺的進入四川，儘快發起對張獻忠的進攻，就是馬士英需要馬上確定下來的事宜。
桌案上面擺著地圖，這是情報司重新繪製的四川行省詳細地圖, 上面標註了被張獻忠佔領之地方以及派駐軍士駐紮的地方。
當下張獻忠直接控制了四川所轄的成都府、順慶府、敘州府、潼川州、嘉定州、瀘州，重慶府大部分地區, 夔州府部分地區，以及保寧府和龍安府的部分地區, 可以說四川行省絕大部分地方都被張獻忠染指, 當然張獻忠的主力主要分佈在成都府周邊。
四川總兵秦良玉討伐張獻忠遭遇慘敗之後, 退守石柱縣，很少主動出擊，參將楊展主要是在夔州府和重慶府一帶活動，伺機進攻成都，不過因為兵力不足等問題，一直都沒有對張獻忠形成直接的威脅。
馬士英率領大軍征伐四川，還有一個非常現實的問題，那就是四川交通條件落後的同時，資訊嚴重阻隔，很少有商賈願意來往於四川做生意，畢竟道路太難走，崇山峻嶺之中也有不少的土匪，稍不小心就會送掉性命，鮮有商賈前往四川，外面的訊息基本傳不進去，朝廷的主要注意力在北邊，亦沒有過多關注四川，譬如說吳橋之戰、景州之戰、鷹澗嶺之戰以及馬欄山之戰等重要的戰鬥，四川境內很少有人知道，恐怕張獻忠都不是很清楚。
基於這樣的情況，馬士英、鄧世秋和程仲地能夠依靠的也就是麾下的十萬大軍。
由此，進軍四川的每一戰都至關重要。
鄧世秋與程仲地建議的行軍路線是從鄖陽繞道前往施南宣府司，經過大田所進入重慶府所轄黔江，爾後直接到石柱縣，與四川總兵秦良玉取得聯絡，這樣行軍的優點是可以完全保密，黔江以及石柱等地無大西軍駐紮，張獻忠幾乎沒有染指，而且此去能夠直接找到秦良玉，可缺點也非常明顯，那就是道路太難走了，好多地方根本就沒有路，還需要大軍開闢道路，很多地方道路的險要程度甚至超過了潼關，這必然導致大軍行軍緩慢。
行軍的速度越慢，訊息越是容易洩露出去。
馬士英沒有選擇這條行軍路線。
地圖上面，已經畫出來兩條清晰的紅線，這是馬士英專門標註的。
鄧世秋詳細看過地圖之後，對著馬士英抱拳了。
“馬大人，水路行軍，不需要專門開路，現如今是冬季，也沒有大水，這的確是優勢，不過此去全部都是逆水而上，大江水急，十萬軍士，五萬匹戰馬，無數的糧草，至少需要五千艘以上的船隻，籌集船隻的難度太大了。”
“從鄖陽直插陝西興安和紫陽，南下進入夔州府所轄太平縣，這是張獻忠進軍四川的路線，屬下倒是覺得可行，只是如此的行軍路線，不利於功課夔州府城。”
馬士英笑了笑開口了。
“鄧總兵，大軍分為兩路，水路與陸路，同時進入四川，其中陸路八萬人，水路兩萬人，陸路經過太平縣，直接前往順慶府，拿下南充，在此駐紮，水路經過巫山，拿下夔州府所在地奉節縣城，抵達萬縣之後走陸路，前往南充，兩軍會和之後，直取重慶和成都。”
鄧世秋楞了一下，用力的拍了拍額頭。
“屬下怎麼沒有想到呢，如此的行軍路線兩面兼顧，南下佔領順慶府，西進佔領了夔州府，南充會和之後可以繼續分兵，一路攻佔重慶府城，另外一路進軍潼川州，不僅可以完全剿滅張獻忠分佈於各地的大西軍，也能夠徹底堵死張獻忠外逃的所有道路。”
說到這裡，鄧世秋立馬對著馬士英抱拳。
“馬大人，屬下願率領兩萬軍士，從水路進軍夔州，保證拿下夔州府城，徹底剿滅張獻忠安置在夔州府城的大西軍。”
一直沒有開口說話的程仲地也對著馬士英抱拳，願意領兵進攻夔州府城。
馬士英略微思索了一下點點頭，鄧世秋與程仲地都是皇上最為信任的武將，有勇有謀，能夠承受重託，拿下夔州府城沒有多大的問題。
“好吧，我這裡有一封信函，是皇上寫給四川總兵秦良玉之信函，鄧總兵與程總兵領兵抵達萬縣，派遣斥候告知秦良玉，迅速趕赴大竹縣與你們見面，你們見到秦良玉之後，可告知我十萬大軍已經進入四川，必定徹底剿滅張獻忠，秦良玉所轄白桿兵交由我直接指揮。”
“楊展目前所在地方我還不是很清楚，若是楊展在夔州一帶活動，直接將楊展麾下軍士編入你們所轄的大軍之中，令楊展一同前往南充，與我們會和。”
“鄧總兵，程總兵，我要特別告誡你們一件事情，夔州與重慶不少地方計程車紳富戶，不服從朝廷之調遣，甚至殘害朝廷派遣到四川之地方官吏，皇上對此深惡痛絕，這些情況秦良玉與楊展悉數知曉，遇見這些士紳富戶，萬萬不要手軟，直接予以清剿，抄沒其家產。”
“面對秦良玉和楊展二人，亦要明確告訴他們，不管他們麾下有多少的兵力，也不管這些兵力來自於何處，必須要歸於我們統一指揮，決不可各行其是，若是二人不服從命令，你們可以直接拿下，不必心存顧慮。”
“好了，行軍路線已經確定下來，明日就開始行動，我抽調一萬五千參與過馬欄山之戰的將士，交付與你們，你們自行抽調五千人，務必以最快的速度發起對夔州府城的進攻。。。”