他和相戀的老師也漸行漸遠，因為他的智商在提升，老師跟不上。
至於科學家——
查理和阿爾吉農只是他們的成果，科學家們在大會上把他們當“物品”一樣展示，好像不是兩條生命，查理開啟了籠子，讓阿爾吉農在大會上跑了出來。
查理看著一群科學家滿會場的抓老鼠，他笑了。
後來。
查理找到了阿爾吉農，去了紐約。
就在此時，阿爾吉農的療效變差，它變笨了，它死了。
它讓聰明的查理髮現，原來手術機理是錯的，手術只是把智商臨時升高，然後急劇下降。
他預見了自己未來，試圖改變，他說，“如果我能找出結果，只要能對已知的心智障礙增添一絲絲瞭解，能對和我一樣的人帶來幫助，我就會感到無比滿足。無論我的下場如何，我對那些尚未出世生命的幫助，已等於讓我活過千百次正常的人生。這樣就足夠了。”
聰明的查理智商開始下降。
他開始忘掉學過的知識，忘掉到嘴邊要說的話，他漸漸地開始看不懂自己以前看過的書。
他怕自己變得越來越糟，所以他去見了他的媽媽。
他一生不曾停止渴望變成母親聰明的孩子，然而，這時候媽媽神志不清已經認不出他。
查理還見到了自己的妹妹，她長大了，不再討厭他。
他去向那些科學家告別，“我們並不屬於相同層級。我在往上攀升時經過你的樓層，現在我在下降途中再次經過，但我想我不會再搭這部升降梯。所以，此時此刻就讓我們相互道別。”
連篇的錯別字在報告中再次出現。
用錯別字寫作的威力開始顯現，從剛讀時的艱難，順滑，再到艱難，傻查理又回來了。
他說：“拜託，上帝，別把所有的東西都收回去。”
“拜託…拜託不…不要讓我忘記怎麼讀和寫。”
他又變成了從前的查理，又回到了麵包店工作，以前的朋友恨他是真，為他難過是真，現在幫他出頭也是真，但他已經沒有智力去理清這背後的邏輯關係了。
手術徹底失敗。
查理又去低能中心上課，見到了老師，告訴她，“紀尼安小姐，我來上課了，但我的書丟了。”
老師哭著跑出去了。
他突然記起什麼，為老師寫下一段話，讓她不要為他難過，因為他學會了很多以前甚至不知道世界上真的存在的事情；他很高興，即便時間很短暫；他也很高興發現了所有關於家人的事。
以及——
“如果你有機會請放一些花在後院的阿爾吉農墳上。”
這隻老鼠，它很小，它只是人類對自然規律萬千反抗中的一次，卻是最懂查理的朋友。
他記得它。