誰知豐臣秀吉偏偏又怒了，喝道：“比叡山是天台宗聖地，嚴禁殺生之所，孫七郎去過多次，他會不知道麼？既然知道，又為何會在比叡山意外殺生？
身為關白，犯下此等醜事，現在卻只知道向我為他自己辯解，絲毫未有任何補救措施。若是我不向他問詢，他豈不是連辯解都不作了，任由殺生關白的流言四處傳播，敗壞豐臣家的名聲嗎！
這些話你們怎麼不問？怎麼叫無罪？這就是罪！再去問他！問他身為關白究竟該如何作為！立刻去，現在就去！”
比叡山的確是天台宗聖地，也的確禁止殺生，但意外畢竟是意外，三奉行也不知道秀吉為何如此暴跳如雷，只是太閣盛怒如此，他們也不敢多問，只好忙不迭領命照辦。
三奉行因此再來京都面見秀次，並向秀次傳達了太閣的意思，秀次對此極為驚懼。石田三成見了也覺得可憐，便建議道：“在下以為，關白殿下或可寫下一封自辯書，在下也將進言，請太閣殿下親自向天下宣告殺生關白實為謠言。”
增田長盛也附議道：“依在下看來，太閣殿下最為關心的乃是比叡山，還請關白殿下能給予比叡山以恩惠，並向天下發布禮教典令。”
前田玄以補充道：“光是如此恐怕還不足以令國中信服，需要一名宣傳謠言的罪魁禍首來平息此事。”
秀次聽後認為有理，由此親自寫下起請文全力自辯，並請三奉行帶回。
然而三奉行走後，秀次仍覺得不安，最終還是主動放棄關白之位，去往高野山自我流放。豐臣秀次在高野山的青巖寺感嘆自己作為太閣殿下的木偶走到今天這一步，雖然也稱得上是有趣的人生，但是若有來生，他卻不想再作豐臣秀吉的外甥。
秀吉從石田三成處得知秀次躲去高野山後十分吃驚，而且秀次自己流放的行為很快就會令國人知曉，會對自己說長道短，有礙豐臣威信。本欲私下了事的秀吉為避免國內議論紛紛，便想著乾脆將秀次前往高野山的行為說成奉自己的命令列事。
石田三成詢問用何原因，豐臣秀吉思前想後，便以涉嫌謀反為由暫時解除其左大臣、關白職務，流放高野山。
秀吉叮囑石田三成，說先將秀次幽禁一月，再傳出嫌疑消除的訊息，然後將他帶回。按照秀吉的想法，如此一來就可以將一切遮掩過去，一切的一切都變得合情合理，秀次本人也能被帶回來繼續做他的關白。
當豐臣秀次“有謀反嫌疑”而被幽禁在高野山的訊息傳出之後，當時在京的德川家康與家臣本多正信、本多正純都感覺事態已經愈發有趣。
除了德川之外，諸多大名其實平日廣受秀次善待，但對於太閣與關白的關係變化，大名們則都不願涉入其中，一則是此事複雜敏感，二則也是懾於秀吉威勢。
幾日之後，秀次家臣都再勸秀次前往大坂，秀次卻認定自己在豐臣家中已無立足之地而不願前往，家臣勸道：“屬下認為您應該直面太閣殿下，告訴太閣殿下您內心的想法。而且您的側近及部分親族之所以都來了此地，也是太閣殿下希望能安定殿下之心。”
秀次微微挑眉，問道：“太閣殿下是想令我麻痺大意，才好將我完好無損地拿下麼？”
這話問得有些意思，秀次這是知道太閣要拿下他輕而易舉，只是如果堂堂關白鼻青臉腫甚至缺胳膊少腿的被拿下，那就難免讓豐臣家威望掃地了。
家臣自然也懂他的意思，堅稱絕無此事，秀次便輕笑道：“我也不知自己從何時開始變得如此敏感多疑……好了，我都知道了，我會保重的，有勞諸位。”
見他還是拒絕，眾家臣也沒辦法強迫，只好無奈告退。
數日之後，豐臣秀次正在高野山青巖寺與僧人隆西堂下棋飲茶，隆西堂問道：“關白殿下還要繼續在此躲避多久呢？您心中就不想與太閣殿下重歸於好麼？”
豐臣秀次答道：“我被幽禁一月，而且種種事件令我已不敢再信任他們，我也不知從何時開始愈加害怕，應該就是從少君出生後就開始了吧。我隱隱感覺死期將至，時而惴惴不安，時而渴望解脫、往生極樂……您認為我當如何抉擇？”
隆西堂道：“關白殿下，阻礙您的是您的心魔，造成如今局面的是天下間名為權利人心的心魔。世人多為此困擾，無數悲劇也由此引發。至於如何抉擇，卻只有關白殿下您自己才能作出真正的抉擇，旁人的指點於事無補，也未必有益。”
秀次沉默著沒有回答，正巧侍從來報，說福島正則、池田秀雄、福原長堯奉太閣之令而來。豐臣秀次嘆了口氣，還是接見了三人。
一見他們，秀次便問道：“福島，連你也來了，太閣殿下有何示下？”
福島正則道：“關白殿下，我等帶來的是您的罪狀書：身為關白而不自謹，陰謀反叛太閣。您的幽禁即將結束，請隨我一同面見太閣，陳情罪狀。”
秀次不知秀吉是要藉此來個舅甥相見冰釋前嫌的把戲，聽到此言不禁渾身微微發顫，悵然道：“太閣殿下果然是要我去死麼？”
福島正則嘴角微笑，口中卻還勸解道：“關白殿下，您怎能如此想呢？只不過是請您回去陳情而已，切勿多慮。”
豐臣秀次深吸一口氣，目中露出決絕神色，點頭道：“請諸位在此稍候，我自收拾行裝之後便隨同諸位前往大坂。”福島正則自然不怕他會跑，因此也不多說，只是起身告退。
此時的豐臣秀次早已萬念俱灰，也不想再受任何屈辱和責備，他飲下最後一次酒，留下辭世歌：“如吾心觀不盡花月，於塵世不留半點浮思。”然後剖腹自盡。
福島正則正在別室等待，秀次的侍從詢問關白是否已獲太閣原諒，福島正則漫不經心地回答道：“這我哪裡知道，我只知道太閣殿下令我前來帶關白殿下回去，不過可能關白是做不成了……嗨，其實他這關白做得還算不錯的。”
這時突然傳來豐臣秀次自盡的訊息，福島正則雖然與秀次關係不睦，但陡然聽說他已經剖腹，還是吃了一驚，急忙趕去檢視。眾人緊隨其後，眼見秀次已死，皆是悲痛萬分。
不僅秀次本人，他側近四人在西堂殉死，其餘侍從也於西堂附近集體剖腹，所有人的屍體都是一臉肅然，絕無半分猙獰、痛苦。福島正則呆呆看了一會兒，發現秀次最後的面色之中似乎帶著一抹解脫。
朝秀次屍體鞠了一躬之後，福島正則神情複雜地下令將豐臣秀次的首級帶上，去向太閣殿下覆命。
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