普巴金剛頭有三面，正面是藍色金剛手菩薩，也就是金剛薩埵，配屬金剛部；右邊是白色大威德明王，配屬蓮花部；左邊是紅色馬頭明王，配屬寶部。
普巴金剛有單身及雙身兩種，分別代表生起次第及圓滿次第修持法的本尊。
如果示現單身者，手上一定會拿一個“卡章巴”，也就是人頭骨，以表雙身空有不二的圓滿義。
像東密每尊本尊都配屬有一尊佛母，亦是用來表達雙身圓滿的理趣。
普巴金剛右手拿的是九股杵、五股杵；左手拿的是火焰、“卡章巴”；中間雙手捧持的是普巴金剛杵。
右腳踏著一男，左腳踏著一女，代表降伏空有偏執，男表有，女表空。
手上抱著佛母，全身是藍色的，右手拿“卡章巴”及左手拿嚘巴拉，也就是頭蓋骨，裝甘露的法器。
普巴金剛杵頭上有代表佛部的五股杵、馬頭明王、豬頭等多種造型。
普巴金剛現忿怒像，黑蘭色，修觀本尊，以其充滿精力的佛行事業和獨特的除障能力著名。
從前藏密剛傳入時，曾一度懷疑普巴金剛法是苯教所傳的外道，後來薩迦法王取出梵本證明此法不虛，才平了眾人之疑。
古代藏密，以普巴金剛為主要本尊，而弘揚普巴法統，寧瑪巴與薩加巴特重視之。
元一前世曾經得到過薩迦巴上師指點，便學習過完整的普巴金剛法門。
修持時，普巴金剛的形象及手上拿的法器、心中觀想黑色種字“hu”等都要觀得非常清楚。
修持密宗的人，往生後眉間骨是燒不壞的，因為他們觀想都是在眉間骨處。
修到最後要能現出普巴金剛的高大身及吽字變現無量無邊的普巴金剛杵射出去，最後得虹光成就。
全身轉化成虹光的主要關鍵在於能量的轉換，在於如何將能量聚集在身體的某個點，然後分解、釋放；而能量聚集的最基本法是觀種字、咒鬘，將能量慢慢集中，歸入氣脈。
然而，輪脈的開，依不同的本尊有不同的輪脈修持。
所謂的觀想是在輕鬆的狀態下觀想，讓心慢慢地沉淨下來，然後利用觀想把身體的能量，聚集在某個部位。
當確實能掌握時，再善用這股能量來開身體，此是每位修行者必經的重要過程。
修持普巴金剛法前，一定要先脩金剛薩埵百字明，此兩者有相互為用密切的連帶關係。
在轉普巴金剛杵時，要想自己是普巴金剛。
其次第如下：
先，普巴金剛杵正面向前舌頭伸出者即是）。
次，左右轉，一邊轉動，一邊誦持普巴金剛咒。
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