當葡萄牙人經過達·伽馬和卡布拉爾指揮的兩次遠航後，已經基本瞭解印度洋的季風規律。司令官知道需要趕在夏季結束前利用季風快速抵達馬拉巴爾海岸，因此葡萄牙艦隊沒有在基爾瓦逗留過久。
在橫渡印度洋抵達馬拉巴爾海岸之前，達·伽馬略過其他港口城邦，徑直抵達馬林迪補給。馬林迪蘇丹是唯一對葡萄牙人以笑臉相待的東非統治者，他熱情地接待老朋友達·伽馬的到來，而司令官的態度也相比先前緩和許多。
葡萄牙艦隊隨後向東北方向開進，先是於8月20日抵達馬拉巴爾海岸附近的安賈迪普島，依託此島為基地攻擊附近的幾個港口，隨後又於9月初沿著海岸南下至坎納諾爾附近的一個瀉湖，依託這裡的有利地形繼續進行海盜活動。
在出發時，曼努埃爾給這支艦隊以書面形式下達兩道命令，第一道是給達·伽馬的——“東印度海軍司令應該果決地使用最為強硬的手段從卡利卡特扎莫林手中討到葡萄牙應得的一切。”
曼努埃爾對於扎莫林十分輕視，從他所提出的條件中就可以看出——要求扎莫林對葡萄牙在印度損失的人員和貨物進行合理的賠償；要求扎莫林依照葡萄牙宮廷的指示驅逐所有的u斯林商人；擴充套件先前所議定的貿易協定等。
第二道命令則下達給索德雷兄弟，他們奉命“控制紅海的出入口，確保麥加u斯林的船隻既不能進入紅海，也不能出來，因為自古以來，我們和他們就是不共戴天之仇，他們最為仇視我們，對我們進入印度的阻撓最大。並且他們掌握香料貿易，所有自印度的香料經他們手流入歐洲。”
對於前往卡利卡特途中所進行的海盜活動，隨船的義大利商業代理人知趣地裝聾作啞，達·伽馬也派人通知他們：“不要過問途中發生的任何事，這和你們無關。”
在瀉湖旁的海岬上觀察附近水域的瞭望員發現了正在沿岸航行的一艘大船，這件事被迅速上報，司令官下令調遣幾艘船隻埋伏，艦長和水手們興奮地執行命令。
令達·伽馬意外的是，這艘商船對於攔截他們的“海盜”頗為順從，幾乎沒有做任何抵抗葡萄牙水手就控制住了這艘大帆船。
經過審問船長得知，這艘船叫米里號，擁有武裝，剛從漢志返回，船上載著的都是朝覲者和他們的財產。其中不乏富裕的商人，包括馬穆魯克在卡利卡特的商業代理人法基，他擁有多艘商船。
對於這些腰纏萬貫的富商而言，在印度洋遇到海盜最慣常方便的做法就是交買路錢，這已經形成了慣例，他自信可以用金錢再度買到安全。
他主動提出條件，包括出資為葡萄牙人修復船隻、在卡利卡特為葡萄牙人提供香料並免費為他裝滿最大的四艘船，同時向葡萄牙方交出人質以確保承諾能被履行。
出乎意料的是，司令官對這些條件不為所動，而是命令船上的商人自行交出所有的財產，商人們在受刑之前就交出大批財物。
但司令官堅持認為他們藏匿財物，但令其他葡萄牙人無法理解的事，他似乎秉持著奇怪的原則，他既不肯接受對方主動提出的條件，又直截了當不下令徹底洗劫這艘船隻，真是不可理喻：“好好想想那船上的珠寶和貨物！”
司令官無視部下的異議，繼續自行其是地推行這他自己的計劃。
一隊葡萄牙水手在他的命令下先是拆除了米里號的船舵和風帆索具，隨後又開始安放火藥並點燃，如果事情就這樣發展下去，船上的數百名u斯林將會被活活燒死。
米里號的乘客們意識到了事情的嚴重性，他們撲滅了船上的火焰，並找出一切可以用於自衛的武器。葡萄牙人見這艘商船沒有被點燃，於是載著水手的小艇重新靠近米里號。<u斯林隨即利用居高臨下的優勢向小艇射出或投擲一切能夠造成傷害的東西。葡萄牙人使用火繩槍和迴旋炮回擊，但這些火器僅殺傷了寥寥幾人，根本無法破壞船體。<u斯林所展示的財富足以贖回所有被囚禁在馬格里布的基督徒，剩下的財物哪怕對於國王陛下來說也是一大筆錢。”一位將全過程記錄下的書記官帶著明顯的疑惑寫下這段文字，其他葡萄牙人同樣無法理解司令官的動機。
司令官只是透過艦長室的觀測孔觀察著遠處的米里號，沒有回應來自部下和對方的任何訊息。
喪失動力的米里號就在司令官的放任下在酷熱難當的印度洋海面上飄了近一週，直到第六天司令官才下令要“用積極的行動消滅這些u斯林。”
書記官記錄下了米里號徹底覆滅的日期，並稱：“我將永遠銘記這個日子。”
卡拉克帆船靠近米里號，用火炮轟漏其側舷，但經過幾天的折磨，乘客們士氣十分高漲，突然丟擲的抓鉤和繩索在兩艘船之間搭建了通道。
葡萄牙人顯然是沒想到對方竟然還能主動出擊，被打得猝不及防，一下子遭受到暴擊，被登上卡拉克帆船的u斯林打得節節敗退。
只是達·伽馬派來監視這艘商船的可是足足六艘戰艦，另一艘卡拉克迅速加入戰局，從另一側靠近米里號，迫使已經登船的u斯林被迫回防。<u斯林的鬥志和勇氣，認為他們值得尊敬。<u斯林的拼死抵抗和風浪，葡萄牙人無法再登船點燃商船，最終還是在有一個乘客主動游到葡萄牙的小艇，告知願意用繩索將米里號和一艘葡萄牙船隻進行固定，並且值錢的財物都已經被扔入大海，基本俘虜這艘船也搜不出什麼戰利品了。
最終達·伽馬還是如願以償地燒燬了這艘船，大多數乘客都被活活燒死，葡萄牙人將一些跳入大海的撈了上來，最終僅有領航員和一些兒童倖存，他們都被強制皈依基督教。
這樣極端的暴行讓諸多葡萄牙人都感到費解，但對達·伽馬來說，這僅是一切敵對行為和暴力的序幕，他已經熱血沸騰。
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