如此，以段智為，另外調來東平府的杜百川，加上魯智深，楊帆組建了一個簡單的幕僚班子。這其中，段智主要負責政治方面的事務，杜百川負責商業方面的工作，而魯智深則負責保衛、偵察等打打殺殺的事情。
組建這個幕僚班子的同時，楊帆亦飛鴿傳令梁山那邊，讓梁山訓練班第一期的全體學員立即出，到應天府與自己會合。所謂知己知彼，百戰不殆，楊帆要建立樞密院軍事調查統計局的江南站，負責戰時情報的收集與傳送。
第三項主要的準備工作卻是神機營人員的分配。此次出征，面對被方臘攻陷的城池，官兵方面的攻城戰是不可避免的。在樞密院制定詳細的作戰計劃中，楊帆提出的利用火藥攻城的策略被普遍採用，因此三路大軍皆需配備部分神機營的兵士。
如今的神機營已擴編到了一千餘人，這其中有六百炮兵，四百步兵。本次出征，由於童貫力求戰決，故而擱置了出動炮兵的計劃，改為炮步兵攜帶火藥包，以備爆破城門、城牆所用。
楊帆根據計劃，抽調神機營三百人，分作三個小隊，配備給三路大軍。此次隨軍實戰的神機營人數不多，不過神機營這把刀，楊帆也不願過早地暴露於天下人面前，故而楊帆也沒有刻意去爭取讓神機營立功的機會。
十一月二十六，童貫、楊帆率領京畿禁軍一萬餘人，從開封出。他們先要到應天府，與從太原出的西軍會合，然後兵分三路向江南進。作為趙佶任命的兩湖制置使，楊帆介時將與西軍統領劉延慶共率西路軍，收複宣州、睦州、翕州等地。
而南方，方臘在攻取翕州的同時，東路軍則馬不停蹄一連攻下桐廬、富陽等地，兵鋒直指杭州。方臘的勢力在此過程中進一步的擴大，義軍便如滾雪球一般，迅膨脹到六十萬人。
十二月初，方臘大軍十萬餘人攻向杭州。
此時杭州城內守軍不過五千餘人，由統兵制置使陳建率領。這五千人馬顯然很難守得住杭州。杭州城內除了陳建之外，還有兩個主要的官員，一個是杭州知府趙霆，一個是代皇帝偵伺各地情況的謙訪使趙約。此時，他們已經驚慌失措，做著出逃的準備。
自方臘欲攻取杭州的訊息傳來，趙霆等官員便開始秘密地將自己的家産向北方轉移。
十二月初十，方臘義軍大兵壓進。這天，趙霆藉著巡視城防的名義，只帶了幾個隨從，悄悄地溜出城去，逃向北方。
這日裡商議守城方略的會議，趙約見趙霆遲遲不到，便派人去杭州府衙催促，結果自然是不見趙霆的人影。此後一日仍是如此，眾人明白趙霆已然棄城而逃。眾人此時各懷心思，雖然很多人對趙霆的做法心懷不憤，卻也只是低聲的斥責幾句，而大多人心裡恐怕已經在考慮：是該想辦法出城避難了。
不過，也就在此時，京城快馬送到的一紙聖令，讓這些人逃跑的想法蒙上了一層重重的陰影：凡棄城而逃之官員，非但本人一律斬，而且其家人男子充軍，女子入奴。聖令之上，還列舉了朝庭對梁世達、張徽言等一串前例的處置結果，以儆效尤。
有了這些前車之鑒，那些想逃跑的官員不得不暫時安下心來，真正努力地備防。當然，這其中有些在京城有關系的便拼著家産，差人去京中打點關系，希望能弄一紙調往北方的調令，完全不顧當時同樣花了大價錢託人調到了這人間的天堂。
十二月十八，杭州城下煙塵滾滾，方臘二十萬大軍兵臨城下
蘇州。
進入十一月以來，城西的刑場之上較平時忙碌了很多。這塊以往每年都用不了幾次的地方，現在幾乎是每隔幾天，便有幾十人在這兒被砍了腦袋，而他們的罪名只有一個：明教叛逆。
這是東南王朱勔嚮明教的怒火。
朱勔的兒子朱汝賢奉其之命攻取明教總壇，然而剛剛入冬之時朱汝賢所率的五千昭武軍戰敗撤退。聽得這個訊息，朱勔立即差人前去軍中傳令朱汝賢馬上回府，以備諮詢。
可是傳令之人到了軍中，得到的訊息卻是朱公子兩個月前便外出徵糧，一直未歸，否則大軍也不會因糧草不足而敗退。
這個訊息不會出錯，朱勔一聽之下，禁不住心中一驚。他立即動府上的高手、私軍進行調查，很快現朱汝賢前段時間曾回府一次。據府上的管家所說，那次回府朱公子差人從府庫取了大量的金銀財帛，聽意思是看上了某家的小姐，要向其提親
循著這條線索，朱府很快將目標鎖定在了太姥山東麓的瀲城村。可趕到此村之時，朱汝賢提親的物件楊府一家已經舉家搬遷。找到幾個被遣散的楊家下人，問得楊家已經遷入了京城。朱勔自然不會罷休，差人找到京城，得到的訊息卻是：朱汝賢確實前去瀲城村提過親，楊家沒有答應，幾天後的晚上，便有兩股不明身份之人，在楊家府上廝殺了大半夜。楊家上下那夜無人敢出門，所以不知外面情況，等天亮之後，便現府內府外打殺的痕跡已被清洗，夜裡究竟是什麼人自然也無從知曉。此夜過後，楊家怕這些不明身份之人前來報複，便躲到京城來避難。
這種說法自然無法讓人相信，若按朱勔以前的做法，定是要將楊家上下抓了下獄，然後一個個的拷問。不過此時，他卻無法這樣去做。原因非但是那楊家家長楊博遠之子乃是京官，而且朱汝賢當時求親的物件楊心蘭楊小姐，據說已經被康王趙構相中，欲選為王妃，不日便要被迎入康王府。