在這一刻，碇真嗣的眼神突然變得堅定起來：“我決定了，使徒和新世紀福音戰士我會從這個世界上徹底抹除，但我會保留神明的力量，在全人類面前演一場戲，讓所有人都認為神明已經徹底滅亡，而我則要守護著這個世界的人類文明，直到他們成長起來，不再懼怕來自世界之外的力量干涉！”藍諾臉上不動聲色，只是點點頭道：“我尊重你的選擇。”但內心卻已經露出了計劃通的一般的表情。
有些話正面去勸說，未必能夠起到效果，藍諾如果直接去說，讓碇真嗣保留一下神明的力量，那他還真未必會聽，畢竟從他的角度來看，使徒，神明，這些就是這個世界悲劇的根源，只有將這一切全都抹除，才能讓人類重新將命運握在自己的手中。
但現在，藍諾只是做出了一定的引導，讓碇真嗣認識到了保留神明力量的必要性，不需要他勸說，碇真嗣自己也會做出這樣的覺悟來。
“很高興你有守護自己文明的覺悟，不過有覺悟的同時也要有對等的力量，你應該已經認識到了，在我們使用完全對等的身體完全對等的工具的情況下，你和我，乃至是我的叢集之中的任意一個個體之間，都有著巨大的差距吧。你現在掌控著神明的身體，的確已經十分強大。但你卻遠遠無法發揮出這具身體真正的力量。也沒有足夠的知識來駕馭它，如果你想的話，可以跟我們一起，前往新的世界，在那裡你會有機會提升自己，有機會學習到更多新奇的知識，甚至你可以將自己的力量用來改變其他文明的未來，給他們締造出一個光明的前途。”碇真嗣會有的暢想那樣的未來，隨後點點頭道：“如果我的世界沒有遇到入侵的話，我會考慮的。”碇真嗣其實也認識到了提升自己實力的緊迫性，藍諾就已經是一個他看不透的存在了，即便現在擁有了神明之軀，他也不敢保證面對全力以赴的藍諾叢集，就能保護他所在的世界，而既然作為守護文明的一方有藍諾這樣的強者，那身為破壞者，身為肆意妄為者的一方，理應也有同等層次的存在才對。
甚至可能會有更強大的存在。雖然這種擔憂看起來有些杞人憂天，但在這個世界已經遭遇過一次這種慘重的損失的情況下，他還是覺得自己的擔心是有必要的。
“第一百二十八次推演已經完成了，我已經檢測了這個執行方案的每一個步驟，基本可以確認，不會有任何紕漏，你可以最後再審閱一遍，然後就可以執行了，接下來的未來的大方向就會按照我們所規劃的發展的。”藍諾進行計算迭代的方式，簡直就像是在卡bug一樣。
在開啟了預演的情況下，藍諾就相當於可以預知到十五分鐘之後所發生的事。
這也就意味著，他可以知道計算機十五分鐘之後的計算結果，而當下一次預演開啟之後，他就可以將上一次的運算結果直接輸入，讓裝置從上一次計算結束的位置開始繼續。
如此一來，現實之中看起來只過去了一天不到的時間，那顆龍眼大小的奇異夸克計算機，卻已經完成了上千年的龐大計算任務，幾乎將人類補完之後一切可能出現的紕漏全部都排除掉了。
碇真嗣並沒有那麼龐大的計算力，但在檢查了一遍未來可能發生的一切的推演之後，也認為並沒有什麼問題，於是初號機重新從太空之中降落下來，隨後所有人就看到，潔白的聖光籠罩了整顆星球，緊接著意識就進入了恍忽之中，在不知不覺之中，一些記憶就被悄無聲息的竄改。
或許未來這些人解開了基因鎖，或者是在某些機緣巧合之下，可以找回真正的記憶，但等到那時候，這些記憶的影響也就微乎其微了。
整顆星球都開始了一場洗牌，改變的並不只是人類，同樣還有這顆星球。
雖然第三次衝擊的破壞被侷限在了一座城市之中，但第二次衝擊帶來的破壞，卻已經體現在了這顆星球之上。
整顆星球的海洋都變成了血紅色，從那之後，地球就再也不是一顆藍色的生命星球。
而這一切的傷害在此刻則全部被扭轉過來，海洋重新變回了原本的藍色，微生物重新出現在海洋之中，緊接著是藻類植物，動物，這些物種的基因都被儲存下來，就儲存在神明的身體內。
畢竟這些生命本身就是莉莉絲流淌出來的血液所演化而出，他們的基因庫本身也就儲存在莉莉絲的靈魂之中。
此時進行生態重塑毫無困難，最重要的其實還是洗滌了這顆星球上at力場的汙染。
這才讓海洋恢復生機。當然，同樣的為了讓那場並不存在於現實中的戰爭，為了那場只存在於記憶之中的戰爭足夠逼真，初號機還像是捏臉一樣，塑造著星球之上的地形，在一些城市之中，製造出巨大的爆炸坑和輻射殘留。
讓他們看起來像是被核武器轟炸了一般，同時將被爆炸炸沉的本州島，偽裝成了大陸架斷裂之後才沉入海中的模樣。
在龐大的計算力輔助之下，初號機不會錯過這顆星球上任何一個細節，當所有人清醒過來的瞬間，這顆星球就會保持在如同真正的剛剛經歷了一場大戰的狀態下。
即便是神明，在做過這一切之後，也感到了一陣精疲力盡，而在所有人的記憶之中，他們清醒過來的開端其實是一段編造出來的影像，初號機飛過海洋，將大海修復，將使徒和新世紀福音戰士抹除，最後舉起由人類意志凝聚成的蓋烏斯之槍，插入了自己的胸口徹底消失在了人世間。
而這段影像在現實中卻並沒有發生，初號機在完成了星球的重塑之後，便來到了月球的背面，脫離了所有人的偵查，但卻將神明的力量保留了下來。
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