關於大蛇丸為什麼要毀滅木葉，說法有很多，漫畫中給出的結論是，大蛇丸記恨當初猿飛日斬選擇波風水門，沒選他當火影，所以出於報復的心理，才聯合砂忍對付木葉。
但從後面的劇情來說，大蛇丸完全就是個瘋狂的科學狂人，他所作的一切，都是為了更好的研究忍術，對火影之位根本不在意。
反而真要是讓他當上了火影，他也會扔下工作，前去做實驗，所以根本不可能是因為火影的位置才毀滅木葉的。
而一個相對比較合理的解釋則是，大蛇丸攻擊木葉，是想得到木葉的禁術，以及珍貴的研究材料。
木葉是五大忍村中底蘊最深，實力最強的，哪怕是常年處於內部分裂的狀態，也不是其它忍村能比的。
除了實力外，底蘊也是這個情況。
木葉收藏的好東西有二代火影的大量禁術，初代火影的細胞，大量宇智波族人的眼睛，甚至是宇智波斑的屍體等等。
當然了，木葉的斑，只是影分體，並不是真正的屍體，但大蛇丸並不知道呀。
這所有的人一切，在大蛇丸看來都是其它地方找不著的珍貴資源，只有攻破木葉，才有機會得到。
而像四戰時期的漩渦面具，同樣是在木葉內部，大蛇丸一直沒有恢復雙手，就是因為拿不著這個漩渦面具。
四戰時，村子空虛，才讓他有機可趁，順利拿到面具，然後逆轉屍鬼封盡，解放了雙手，同時還召喚出了四位火影當打手。
從木葉崩塌計劃之後，到四戰開始這數年的時間，大蛇丸都是沒辦法使用雙手的，也就是說，這個時期的大蛇丸，根本用不出太複雜的忍術，這也是二柱子能偷襲得手，成功打敗大蛇丸的原因。
至於說四戰時，為什麼大蛇丸又會突然洗白，轉頭來幫著佐助，這就不得不說大蛇丸的聰明瞭。
大蛇丸要做科技狂人，這是從始至終都沒變的，但數年的逃亡生涯讓他意識到，想要安穩的做實驗，實現自己長生不老的目標，必須要有一個合法的身份才行。
特別是在四戰之後，忍界相對和平了，那麼像大蛇丸這樣的叛忍，絕對沒有活路。
千萬不要以為大蛇丸很強，所以能一直逍遙法外，他的確很強，但還沒強到可以對抗一個忍者村的地步。
別說是他了，就連長門的佩恩六道，不是照樣被打敗了嗎？
而想洗白，就要立大功，而想立功，還有比幫佐助更好的辦法嗎？
從結界倒推就能看出，大蛇丸的選擇太正確了。
他先幫著佐助召喚出了四位火影，這四位火影在最後的決戰中，起到了非常關鍵的作用。
其次大蛇丸又救了包括綱手在內的五影，直接賣了所有忍村一個大人情，你們老大的命都是我救的，事後你們哪還有臉來通緝我呀？
而事實也正是如此，四戰之後，大蛇丸不僅被洗白，還正大光明的做起了實驗，簡直比叛逃之前還自由，這全都是大蛇丸四戰中的優秀表現贏來的。
原著中大蛇丸表現出了極高的政治智慧，而現在也同樣會做出最正確的抉擇，在這一點上，綱手與自來也都遠遠比不上。
三代火影犧牲，大量前來觀賽的火之國貴族死亡，讓整個火之國都動盪了起來。
而木葉的威望也前所未有的下跌，小春與門炎不得不找到自來也，要讓他出來救火，承擔起領導木葉的責任，成為第五代火影。
然而自來也就像原著中一樣，拒絕了這個要求，隨後就提出要找綱手回來接任第五代火影之位。