七月份時，南方初次傳回靖江王伏誅的快訊後，朝中就又有一群人勸進，朱常汸則再次表示“寡人只是受先帝遺命監國，如今定王、永王依然沒有明確死訊，死不見屍，豈可造次”。
如此辭讓，也讓潞王謙遜的形象愈發人所共知。史可法再次上表，再三陳述：
“定王、永王疑似不幸的訊息，傳回至今已有半年，若是能得僥倖，且得知朝廷虛位以待，豈有半年都不能趕到南京之理？”
退一萬步說，史可法的潛臺詞就是，在虛君位以監國的狀態下，朝廷都公示天下三個月了，只要活著，想當皇帝，早就該來了。要是沒來，那就是覺得自己不行，覺得天下沒戲了，擔當不起如此重任，想隱姓埋名苟活！
如果先帝二子都是這樣不敢為天下擔當正統的，放棄皇位的，還有什麼好等？如此國難之秋，救國存續大統才是最重要的！
反覆辨析之下，潞王也算借坡下驢鬆口，然後依然要求史可法想個辦法給把綱常名分梳理清楚。
史可法揣摩之後，又上了表，建議給定王上一個“殤太子”的諡號，顯示朝廷認定他死在獻愍太子朱慈烺之後。認定崇禎臨死時已經意識到，長子會和他一起被闖賊抓獲甚至殺害，次子則有可能活得更久。
如此，就等於崇禎臨死時，改變了立儲意願，把有可能活更久的那個兒子立為新太子、這才請的潞王叔監國。但最終計劃還是趕不上變化，才到了這一步。
這個正統倫常的工夫都做完後，朱常汸才徹底理順了名分，另一邊南京城裡又同期在籌備典禮，最終定在八月十五中秋這天，行登基大典。
身在武昌的朱樹人，提前接報之後，也受詔趕回南京一趟，參加典禮，
反正他留在湖廣的部隊，當時還處在從兩廣返回後的休整期內，基本上要到八月底才能養好傷病，所以八月期間，部隊本來也沒法動作，他這個主帥暫時離開大半個月，並無問題。
他八月初六從武昌啟程，順長江趕路七八天，最終在典禮前兩天抵達南京。
此後一切繁文縟節自不必提，八月十五中秋佳節一早卯時三刻，南京城中主要朝臣就按班就列，進退有序，參加了典禮。
監國潞王朱常汸，再次巡謁孝陵，又祭告太廟，還提前從杭州再次請來了懿安皇后作為先帝遺命的轉述人見證整個流程，連帶著坤興公主也參加了典禮。
做足了工夫後，朱常汸在史可法的領班宣讀下，正式登基，因為沒有跨年，暫時還不用改元，依然是崇禎十七年的年號。但是已經擬定，等來年元旦，就要改元“隆武”，以彰顯武功，恢復中原。
兵部尚書史可法為武英殿大學士，擔任內閣首輔，戶部尚書沉廷揚為文華殿大學士，擔任內閣次輔。
為了籠絡人心，朱常汸還給他們都封了伯爵。武將當中，此前在擁立監國、以及後來遏制福王的過程中有主要功勞的將領，也有兩個撈到了伯爵，分別是黃得功和張名振。
黃得功是朱樹人派去提防福王從鳳陽入侵信陽、擴大地盤的。張名振則是運氣好，當初堵住了劉良左渡江。但他們的功勞畢竟要低一級，這些伯爵都是不能世襲的，只有他們本人可以終身擔任一代。以後再有功勞，可以酌情再加賞。
其他平叛有功的將領，不夠突出卓著的，凡是原本就有總兵官級別，如今也都給個將軍號，提高榮譽待遇。
另外，朱樹人在這次平定兩廣、回事途中順便還把兩廣和江西交界的贛南山區流賊殘部打擊了一下，整個過程中，朱樹人也給了一些此前崇禎時期被戴罪立功禁錮的降將以表現機會。
比如，一直堅持到張獻忠死前才投降的李定國，因為這一世是在崇禎末年被解決的，所以哪怕戴罪立功，此前也不好給官職。
朱樹人為了用好李定國、孫可望等人，也是煞費苦心，這次就帶著他們一起，去平叛靖江王的途中刷功勞。朱樹人還不好用流賊舊部去直接打叛亂藩王，怕被人指責“以疏間親”，所以就只能讓李定國在贛南山賊身上刷刷。
好在此前殘留在贛南的山賊，基本上也是崇禎十五年時、張獻忠在衡州決戰中被朱樹人打崩後，往西逃散的那部分偏師。
所以李定國孫可望奉命去剿輔並用，也算是非常順利，當地頭目聽說朝廷可以既往不咎，只要處理幾個截殺守法藩王的典型，其他人都能投軍，還足餉確保不被剋扣，也就大部分歸降了。極少數死硬分子，也成了李定國刷功勞的人頭數。
有了這一波名分，朱樹人就順勢幫他們請功，讓孫可望、李定國都暫時得了一個參將的級別。後續是否能升遷，就看他們帶著改過自新的西軍舊部，能不能好好在北伐當中立功了
總的來說，潞王朱常汸登基後這一波升賞封爵，已經是很剋制了。相比於歷史上福王登基時、直接給江北四鎮和左良玉都普髮式封伯甚至封侯；朱常汸給出的大明爵位依然是值錢的，沒貶值太快。
當然，所有應該被升賞人裡面，最應該被升的，還是朱樹人。
可惜他太年輕，而且他的生父已經被架到了內閣次輔位置上，他也不可能入閣。而爵位方面，崇禎臨死前最後一個月，當時為了勸誘朱樹人北上勤王，已經把他的克虜侯升為鄂國公了，這也沒法再升——
至少目前為止，潞王還沒頭鐵到覺得“因為朱樹人被先帝賜國姓，也姓朱了，所以就可以封王”。
歷史上鄭成功在永曆後期倒是被封為延平郡王了，孫可望李定國甚至被封過一字王，但那是爵位徹底不值錢、朝廷崩摧流浪之後的事了。現在南京朝廷還算穩固，朱樹人的功勞也不夠格破例。
最終各方權衡折衷，朱樹人總算是被“加兵部尚書銜、總督湖廣兩廣四川諸軍事”。
也就是把他的總督轄區，從湖廣一省，擴大到湖廣、兩廣、四川三省，等於是南明朝廷自江西以西的一切事務，都歸朱樹人全權掌握。另外為了配合數省的轄區，自然也要加兵部尚書銜了。
明朝慣例，一般總督一兩個省的可以不加兵部尚書銜，或者只加兵部侍郎銜。但總督三省及以上，就必須加兵部尚書銜，才能統籌全域性——朱樹人穿越之初，他的第一位官場引路人楊嗣昌楊閣老，就是加兵部尚書銜總督六省軍務。
朱樹人花了整整五年半，才算是爬到勉強能跟穿越之初楊嗣昌相近的位置，但他的總督區還是小了點，而且少一個大學士、閣老的頭銜。