關佔元之所以在九州島的近海還敢下令艦隊全速行駛，是因為他手裡有一張航海圖。
這圖是何提臺交給他的眾多作戰地圖中的一張，上面詳細的標出了自壹岐島直到長崎港以南一百多里處的航線。
沿線的岸形、島嶼、礁石、水深，岸防炮的位置和數量都標記的清清楚楚。
關佔元一直感到有些驚訝，何提臺如何能有長崎近海如此詳細的海圖？
他卻不可能知道，這是輿情司的大量人手用了近兩年的時間蒐集的。
因為日本其他的港口嚴禁商船駛入，所以只有長崎港周邊的航線可以偵察測繪，清國的諜報人員自然不會放過這個機會。
在手持信牌來到長崎港貿易的商船中，有幾艘船上從東家到夥計，連同船員全部都是輿情司的人。
他們是吳波在幾千人中精挑細選出來的，不僅做起生意來精明能幹，其中還都是一些諜戰老手。
情報蒐集、地圖測繪、化妝偵察、近身格鬥甚至綁架暗殺的人才應有盡有。
雖然做生意只是他們的幌子，但在吳波的精心策劃和嚴厲督促下，他們的生意做得有模有樣，風生水起，任誰也看不出一點兒破綻來。
商船停在長崎港口等待卸貨和裝貨的日子裡，他們也從來沒有閒著，大量的隱秘事情都是在這期間做的。
當一艘船上的貨物裝完，船上的人帶著蒐集來的所有情報即將離開時，另一艘船又駛進了長崎港，接著完成明裡暗裡的各項差事。
這時的長崎有一部分是幕府的直轄地，還有一部分是肥前國大村藩、平戶藩和島原藩的領地。
但長崎港及所有的對外貿易是歸幕府直接管轄，掌管這裡事務的是長崎奉行，屬於老中直屬的遠國奉行之一。
所謂遠國奉行，是負責管轄江戶以外的幕府直轄地的官員。
長畸奉行是長畸町的最高行政司法長官，還是防備外敵入侵和基督教傳播的最高軍事長官。
現任的長崎奉行共有兩人，按照制度，一個人駐在江戶，負責幕府與長崎之間的聯絡，稱為在府奉行；
一個人駐在長崎，負責一應具體事務的管理，稱為在勤奉行。
長崎有了重要事情不能自行決策時，在勤奉行就要向幕府彙報，等待老中的裁決。幕府則是透過長崎的在府奉行給予答覆，傳遞指示。
這時長崎的在府奉行是田付景厖，在勤奉行是松波正房。兩個人每年九月交代，也就是輪崗的意思。
鑑於長崎位置的重要性，承應二年1653年），平戶藩主松浦鎮信奉命在女神、蔭尾、神崎、白崎、高鉾、長刀岸和大多越這七處修建了炮臺。
寬永十八年1641年），幕府命令福岡黑田家在長崎港入口處的戶町和對岸的西泊兩處修建番所，並駐兵守備。
次年，命佐賀鍋島家前來交代，之後就成為定例，兩藩一年一交代，輪流出兵在長崎駐防。
這兩處番所額定駐兵一千人左右，因此又名“千人番所”。
因為其地遠離江戶，作為中央政府的代表，幕府賦予了長崎奉行很大的權力。
根據實際需要，在處理貿易、宗教或是行政等事務時，長崎奉行的職權範圍可以遍及整個九州島。
根據正德新例的規定，正德五年1715年）幕府在長崎設立目付役所，派出目付常駐。
德川幕府時期的目付這一官職主要的職責是監視家臣的行動，長崎目付自然是幕府派來監視長崎奉行的。
此外，他還協助在勤奉行處理事務，與其一起維護長崎的治安，在緊急情況下一起聯名請求鄰近的各藩出兵防衛。