在飛行船降落前，柯南和越水七槻總算透過懷疑勳、盯上勳，逐步在腦海裡把線索連線起來，鎖定了兇手。
遊戲給出了三個玩家兩個選項。
【結案，兇手就是直樹】
【不，兇手另有其人】
在選擇第二個選項之後，遊戲又讓玩家把一面綠色旗子交到真兇手上。
三個玩家，一人拿到了一面旗子，一共有三面旗子，頗有一種票選的意思。
柯南和越水七槻商量之後，決定由柯南把旗子交給保奈美，毛利蘭跟著越水七槻去劍道館，把旗子交給勳。
這個案子裡，死者三人，兇手有兩個人，勳殺了兩個男孩，保奈美幫忙掩飾，並且殺了直樹。
三面旗子不是為了考驗組隊玩家的團結程度，也不是為了在出現分歧時投票來決定選擇，而是讓他們以旗子數量來明確哪個兇手殺了幾個人。
確實應該給保奈美一面旗子，給勳兩面。
在三個玩家都給出旗子之後，收到了最後一塊碎片。
【鬼子母神碎片：另一個傳說中，鬼子母神的孩子需要人類孩童的血肉餵養，她不斷抓走人類的孩子，是為了讓她的孩子有充足的食物，直到釋迦牟尼讓她帶著孩子成神、她的孩子不需要血肉之後，她才放棄了作惡】
五塊碎片收集齊，融合成了一幅容貌猙獰的鬼子母神畫像。
遊戲也開始以播放過場動畫的形式，把真相播放出來。
這五塊碎片並沒有藏著什麼破案資訊，更像是一種進度標誌，在五塊碎片湊齊時，也代表著玩家通關了。
前三張碎片，是在玩家掌握了保奈美家、正男家的基本情況後獲得，其實有很多資訊藏在那些對話中了。
而那三張碎片不按獲取順序排列的話，又是正男這個第一個遇害的孩子的故事。
【你知道嗎？在這個世界上，有孩子被愛著，有孩子被畸形的愛纏繞著，也有孩子不被愛著。
就算是鬼母，也深愛著她的孩子啊，並且她還因此成神了。
傳說中，鬼母在深夜抓走那些人類孩子，把那些孩子藏了起來，是因為鬼母認為他們的父母不配擁有他們。】
而在直樹死後獲得的碎片，是在說直樹是鬼怪，和最後一張碎片倒序排列，也是在說保奈美和勳母女。
【另一個傳說中，鬼子母神的孩子需要人類孩童的血肉餵養，她不斷抓走人類的孩子，是為了讓她的孩子有充足的食物，直到釋迦牟尼讓她帶著孩子成神、她的孩子不需要血肉之後，她才放棄了作惡。
犯下錯誤的鬼怪，難道只需要釋迦牟尼的諒解，就能被所有人原諒嗎？】
毛利蘭看得再三嘆氣，等動畫播放完，又嘆了口氣，“直樹是犯下錯誤的鬼怪，但保奈美太太和勳也是……不過七槻姐和柯南還真厲害啊，我之前根本沒想過勳是女孩子，而且殺了兩個人，她看起來完全不像是那樣的人……”
柯南和越水七槻你一句我一句，解釋了自己的推理思路。
跟工藤優作推測的一樣，兩人是從直樹的死，開始懷疑上了勳是當年的受害者，再意識到勳是女孩子，從而結合之前得到的所有資訊，推測出了真相。
為了不讓柯南太出風頭、被池非遲懷疑，灰原哀也不時補充兩句，替名偵探分擔著注意力。
“好了，現在遊戲進度已經……”柯南一通推理完，神清氣爽地準備關遊戲休息，突然發現退出遊戲時，頁面彈出了提示框。
【當前遊戲進度95％，請注意存檔，方便您以後繼續遊戲】
越水七槻停住了退遊戲的舉動，認真回想著，“我們還忽略了什麼東西嗎？”
柯南也沒有急著退出遊戲，把整個推理覆盤了一遍，還是沒發現哪裡有問題，“好像沒有吧……”
池非遲坐輪椅到了一群人身上，等兩人糾結完了，才出聲提醒道，“去正男家裡，把正男父親抓起來，他虐待孩子，就算遊戲裡沒有證據，但他襲警是事實。”
在推理沒有問題的情況下，為什麼不考慮一下‘玩家的身份是警察’這個元素？
遊戲裡有‘遵守交通規則’、‘讓人同情家庭暴力受害者’的情節，能看出這個遊戲的策劃者是個很有正義感的人，到了最後，保奈美和勳被抓了，也該想想是不是還有誰應該被請去警局喝茶。
越水七槻眼睛一亮，立刻操作角色往正男家去，“我這就去抓他！”
“我也去！”
毛利蘭操作角色跟上，眼裡還帶著堅定而危險的光芒。